使用 system2 命令时 perl 二进制文件不匹配的问题

Question

我正在尝试从 RStudio 中运行一个可执行脚本。该脚本从终端完美运行，但是，当尝试在 R 中运行它时，我收到以下错误消息：

setwd("/users/admin")
command <- "/users/admin/Test_script.command"
system2(command)

> lib/Bio/DB/HTS/Faidx.c: loadable library and perl binaries are mismatched (got handshake key 0xdb00080, needed 0xc500080)

我正在运行 MacOS X Big Sur，我使用 perlbrew 和 perl 版本 5.26.2，我想问题是 RStudio 尝试使用我的系统 perl 版本 - 但我找不到改变它的方法......

>

有什么想法吗？谢谢！

Answer 1

通过查看基于 perl 的实际脚本，我找到了一种让它运行的方法。然后我能够按照 Michal 的建议按照 https://stackoverflow.com/a/65553736/4253357 的答案解决问题。再次感谢您的帮助！