如何使用CUDA执行struct的深度复制?

时间:2011-07-03 16:20:51

标签: c++ c deep-copy cuda

使用CUDA编程我在尝试将一些数据从主机复制到gpu时遇到了问题。

我有3个这样的嵌套结构:

typedef struct {
    char data[128];
    short length;
} Cell;

typedef struct {
    Cell* elements;
    int height;
    int width;
} Matrix;

typedef struct {
    Matrix* tables;
    int count;
} Container;

因此Container“包含”一些Matrix元素,而这些元素又包含一些Cell元素。

假设我以这种方式动态分配主机内存:

Container c;
c.tables = malloc(20 * sizeof(Matrix));

for(int i = 0;i<20;i++){
    Matrix m;
    m.elements = malloc(100 * sizeof(Cell));
    c.tables[i] = m;
}

即,每个100个细胞的20个矩阵的容器。

  • 我现在如何使用cudaMemCpy()?
  • 将此数据复制到设备内存中
  • 有没有什么好方法可以从主机到设备执行“struct of struct”的深层复制?

感谢您的时间。

安德烈

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

简短的回答是“只是不要”。我说这有四个原因:

  1. API中没有深层复制功能
  2. 您必须编写的结果代码设置并将您描述的结构复制到GPU将非常复杂(至少约4000个API调用,并且可能是您的20个Matrix的100个单元示例的中间内核)
  3. 使用三级指针间接的GPU代码将大大增加内存访问延迟,并将破坏GPU上可用的小缓存一致性
  4. 如果您想在之后将数据复制回主机,则反向遇到同样的问题
  5. 考虑使用线性内存和索引。它可以在主机和GPU之间移植,并且分配和复制开销约为基于指针的替代方案的1%。

    如果你真的想要这样做,请留下评论,我会尝试挖掘一些旧的代码示例,这些示例显示了GPU上完整的愚蠢嵌套指针。