层顺序的输入与层不兼容:LSTM 中的形状错误

时间:2020-12-22 11:47:19

标签: python keras neural-network lstm recurrent-neural-network

我是神经网络的新手,我想用它们与其他机器学习方法进行比较。我有一个大约两年的多元时间序列数据。我想根据其他变量使用 LSTM 预测接下来几天的“y”。我的数据最后一天是2020-07-31。

df.tail()

              y   holidays  day_of_month    day_of_week month   quarter
   Date                     
 2020-07-27 32500      0      27                 0        7        3
 2020-07-28 33280      0      28                 1        7        3
 2020-07-29 31110      0      29                 2        7        3
 2020-07-30 37720      0      30                 3        7        3
 2020-07-31 32240      0      31                 4        7        3

为了训练 LSTM 模型,我还将数据分为训练数据和测试数据。

from sklearn.model_selection import train_test_split
split_date = '2020-07-27' #to predict the next 4 days
df_train = df.loc[df.index <= split_date].copy()
df_test = df.loc[df.index > split_date].copy()
X1=df_train[['day_of_month','day_of_week','month','quarter','holidays']]
y1=df_train['y']
X2=df_test[['day_of_month','day_of_week','month','quarter','holidays']]
y2=df_test['y']

X_train, y_train =X1, y1
X_test, y_test = X2,y2

因为我正在使用 LSTM,所以需要一些缩放:

scaler = MinMaxScaler()
X_train_scaled = scaler.fit_transform(X_train)
X_test_scaled = scaler.transform(X_test)

现在,进入困难的部分:模型。

num_units=50
activation_function = 'sigmoid'
optimizer = 'adam'
loss_function = 'mean_squared_error'
batch_size = 10
num_epochs = 100

 # Initialize the RNN
regressor = Sequential()

 # Adding the input layer and the LSTM layer
regressor.add(LSTM(units = num_units, return_sequences=True ,activation = activation_function, 
input_shape=(X_train.shape[1], 1)))

 # Adding the output layer
regressor.add(Dense(units = 1))

 # Compiling the RNN
regressor.compile(optimizer = optimizer, loss = loss_function)

# Using the training set to train the model
regressor.fit(X_train_scaled, y_train, batch_size = batch_size, epochs = num_epochs)

但是,我收到以下错误:

ValueError: Input 0 of layer sequential_11 is incompatible with the layer: expected ndim=3, found 
ndim=2. Full shape received: [None, 5]

我不明白我们如何选择参数或输入的形状。我看过一些视频并阅读了一些 Github 页面,每个人似乎都以不同的方式运行 LSTM,这使得实现起来更加困难。之前的错误可能来自形状,但除此之外,其他一切都对吗?我该如何解决这个问题?谢谢

编辑:This 类似的问题并没有解决我的问题。我已经尝试了那里的解决方案

x_train = X_train_scaled.reshape(-1, 1, 5)
x_test  = X_test_scaled.reshape(-1, 1, 5)

(我的 X_test 和 y_test 只有一列)。而且该解决方案似乎也不起作用。我现在收到此错误:

ValueError: Input 0 is incompatible with layer sequential_22: expected shape= 
(None, None, 1), found shape=[None, 1, 5]

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

输入:

问题是您的模型期望形状为 (batch, sequence, features) 的 3D 输入,但您的 X_train 实际上是一个数据框切片,因此是一个 2D 数组:

X1=df_train[['day_of_month','day_of_week','month','quarter','holidays']]
X_train, y_train =X1, y1

我假设你的列应该是你的特征,所以你通常会做的是你的 df 的“堆叠切片”,这样你 X_train 看起来像这样:

这是一个形状为 (15,5) 的虚拟二维数据集:

data = np.zeros((15,5))

array([[0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.]])

您可以对其进行整形以添加批次维度,例如 (15,1,5)

data = data[:,np.newaxis,:] 

array([[[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]],

       [[0., 0., 0., 0., 0.]]])

相同的数据,但以不同的方式呈现。现在在这个例子中,batch = 15sequence = 1,我不知道你的情况下的序列长度是多少,但它可以是任何东西。

模型:

现在在您的模型中,keras input_shape 期望 (batch, sequence, features),当您通过此:

input_shape=(X_train.shape[1], 1)

这是您模型看到的:(None, Sequence = X_train.shape[1] , num_features = 1) None 用于批次维度。我不认为这就是您在重塑后想要做的事情,您还应该更正 input_shape 以匹配新数组。

答案 1 :(得分:1)

这是您使用 LSTM 解决的多元回归问题。在进入代码之前,让我们实际看看它的含义

问题说明:

  • 您每天有 5 个功能 holidays, day_of_month, day_of_week,month,quarter,持续 k
  • 对于任何第 n 天,考虑到最近 'm' 天的特征,您希望预测第 y 天的 n

创建窗口数据集:

  • 我们首先需要决定我们想要提供给我们的模型的天数。这称为序列长度(在此示例中将其固定为 3)。
  • 我们必须拆分序列长度的天数来创建训练和测试数据集。这是通过使用滑动窗口来完成的,其中窗口大小是序列长度。
  • 如您所见,最后 p 条记录没有可用的预测,其中 p 是序列长度。
  • 我们将使用 timeseries_dataset_from_array 方法创建窗口数据集。
  • 有关更多高级内容,请关注官方 tf docs

LSTM 模型

所以我们想要实现的图片如下所示:

enter image description here

对于每个 LSTM 单元展开,我们传入当天的 5 个特征,并在 m 时间展开,其中 m 是序列长度。我们正在预测最后一天的 y

代码:

import tensorflow as tf
from tensorflow import keras
from tensorflow.keras import layers, models
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.model_selection import train_test_split

# Model
regressor =  models.Sequential()
regressor.add(layers.LSTM(5, return_sequences=True))
regressor.add(layers.Dense(1))
regressor.compile(optimizer='sgd', loss='mse')

# Dummy data
n = 10000
df = pd.DataFrame(
    {
      'y': np.arange(n),
      'holidays': np.random.randn(n),
      'day_of_month': np.random.randn(n),
      'day_of_week': np.random.randn(n),
      'month': np.random.randn(n),
      'quarter': np.random.randn(n),     
    }
)

# Train test split
train_df, test_df = train_test_split(df)
print (train_df.shape, test_df.shape)\

# Create y to be predicted 
# given last n days predict todays y

# train data
sequence_length = 3
y_pred = train_df['y'][sequence_length-1:].values
train_df = train_df[:-2]
train_df['y_pred'] = y_pred

# Validataion data
y_pred = test_df['y'][sequence_length-1:].values
test_df = test_df[:-2]
test_df['y_pred'] = y_pred

# Create window datagenerators

# Train data generator
train_X = train_df[['holidays','day_of_month','day_of_week','month','month']]
train_y = train_df['y_pred']
train_dataset = tf.keras.preprocessing.timeseries_dataset_from_array(
    train_X, train_y, sequence_length=sequence_length, shuffle=True, batch_size=4)

# Validation data generator
test_X = test_df[['holidays','day_of_month','day_of_week','month','month']]
test_y = test_df['y_pred']
test_dataset = tf.keras.preprocessing.timeseries_dataset_from_array(
    test_X, test_y, sequence_length=sequence_length, shuffle=True, batch_size=4)

# Finally fit the model
regressor.fit(train_dataset, validation_data=test_dataset, epochs=3)

输出:

(7500, 6) (2500, 6)
Epoch 1/3
1874/1874 [==============================] - 8s 3ms/step - loss: 9974697.3664 - val_loss: 8242597.5000
Epoch 2/3
1874/1874 [==============================] - 6s 3ms/step - loss: 8367530.7117 - val_loss: 8256667.0000
Epoch 3/3
1874/1874 [==============================] - 6s 3ms/step - loss: 8379048.3237 - val_loss: 8233981.5000
<tensorflow.python.keras.callbacks.History at 0x7f3e94bdd198>