Question

每当我尝试在R中安装软件包时，都会收到以下错误：

Error in readRDS(file) : unknown input format

这是在我遇到系统崩溃后才开始发生的。我在Windows 7下运行32位R 2.13.0。我尝试删除并重新安装R，但继续得到错误。有没有办法解决这个问题而不删除所有内容（即我安装的所有软件包）并重新开始？

由于

Answer 1

这些是我遇到过的建议：

删除运行R的目录中的.Rhistory和.RData个文件。
运行update.packages()

尝试并检测库目录中的“错误文件”。你可以在R

中做到这一点

# List the library paths
# The issue is likely to be in the first directory
paths = .libPaths()

## Try and detect bad files
list.files(paths, 
       pattern = "^00LOCK*|*\\.rds$|*\\.RDS$",
       full.names = TRUE)

## List files of size 0
l = list.files(paths, full.names = TRUE)
l[sapply(l, file.size) == 0]

删除突出显示的所有文件/目录。如果你真的想要，你可以使用file.remove()。

只有解决方案3适合我。

参考：

R-sig-Debian mailing list
选项3是过去几年不同人提供的答案的组合，包括Chunxiao Xu，Larry Hunsicker和Frank Harrell

Answer 2

运行find /usr/local/lib/R/site-library/ /usr/lib/R/library/ /usr/lib/R/site-library/ ~/.local/lib/ -iname '*rds' -a -size 0，然后删除找到的文件。

Answer 3

Chunxiao Xu和Rando Hinn的解决方案为我工作，只需稍作调整。

首先，将目录更改为个人R包目录，然后运行：find -iname＆＃39; * rds＆＃39; -a -size 0

删除上面列表中包含任意0个长度文件的目录。然后重新打开R（或RStudio）并重新安装已删除的软件包。

您现在应该可以再次列出这些包。

Chunxiao Xu的上述原始建议列出了所有R包目录。但是这些目录的确切位置因安装而异，并且必须为您的安装编辑其地址。

Larry Hunsicker

Answer 4

简单易用：如果是.rda文件，请使用load代替readRDS。然后，您可以将加载的文件另存为.rds并再次尝试readRDS。

Answer 5

以下是我必须采取的措施来解决此错误：

打开您的Rstudio，转到包
请注意您对库路径的安装。（将保存您的包）
转到安装库路径。然后硬删除最近的包
在Rstudio中刷新包裹详细信息

Answer 6

在我不得不在安装多个R软件包的过程中重新启动机器之后发生了这种情况。我删除了最新安装的软件包，方法是删除相应库目录中的文件，重新安装它们，一切都很顺利。我还必须删除库目录中的00LOCK目录。

Answer 7

R包可能有问题。在安装某些打包或复制软件包之后，查看问题是否已发生。

你可以做的是从库中复制所有包并将其保存在某个地方，然后在库中复制一些包并重新启动R测试它，看看它是如何工作的，你必须逐个尝试所有的包。我有同样的问题，这是由于包装问题。

Answer 8

我在几个论坛上检查了这个问题，然后我尝试了这个，它对我有用：

1）首先删除ggplot2包

remove.packages("ggplot2")

2）再次安装包

install.packages("ggplot2")

3）重新启动rstudio并再次安装你的软件包，希望这有帮助

似乎问题在于所需的软件包（在我的情况下是ggplot2）已损坏，并且妨碍了任何新的依赖软件包的安装。

Answer 9

我在打开.RDS文件时遇到了一些问题，＆＃34;错误从连接＆＃34;或＆＃34;未知输入格式＆＃34;。我尝试了几个R版本，版本为3.4.2。以下工作：（我意外地卸载了rstudio并重新安装了它，还安装了旧的R版本3.4.2，我不知道是否有任何变化）

设置新的工作目录
我直接打开RDS文件而不是下载它（所以只保存到临时文件），然后我就可以在R中打开它
我将它从临时文件移动到我的新工作目录并使用Data_Essay_Account <- readRDS("C:/.../newdirectory/Data_Essay_Account.RDS")命令，它运行良好。

不知何故正确地下载它然后移动它不起作用，只有在我在临时文件中。硬删除包对我来说不起作用，因为我最初尝试过。

Answer 10

与此处的前几个答案不同，我的问题并没有通过安装RStudio或清理本地文件来解决，而是通过重写RDS文件来解决。

我可以确认这一点，因为该文件存储在云中，并且无法通过各种Windows和Mac笔记本电脑读取它，但是来自同一S3存储桶的类似RDS文件却可以正常工作。

当我重新编写RDS文件时，问题就消失了。

R中的readRDS（文件）

10 个答案: