在NetworkX中找到加权图的最短路径长度

时间:2020-10-27 13:59:15

标签: python dictionary network-programming networkx

我正在尝试使用networkx确定源节点和目标节点之间的最短加权路径。为此,我正在使用nx.shortest_path。但是,我无法使其正常运行。

以下类似于我的设置:

import pandas as pd
import networkx as nx

df = pd.DataFrame({'F': ['a','b','c','d','d','e'], # f node identifier
                   'T': ['b','c','d','e','f','f'], # t node identifier
                   'weight': [1.2,5.2,2.7,2.8,1.3,7.4], # weight for shortest path algorithm
                   'dummy': ['q','w','e','r','t','y']}) # dummy variable

网络构建是在函数内进行的,如果我能正常运行的话,它将被应用于一些不同的数据集!这也是为什么将属性作为字典而不是单独添加的原因。

def build_network(df=None, column_names=None):
    g = nx.DiGraph()
    
    for i,row in df.iterrows():
          g.add_edge(row[column_names['F']],row[column_names['T']],attributes=row[column_names['attributes']].to_dict())
           
    return g

g = build_network(df, column_names={'F':'F',
                                    'T':'T',
                                    'attributes':['weight','dummy']})

最后,应用shortest_path_length算法,该算法指示长度为2(边的数量),而不是4.0(加权距离)。我怀疑这是因为我错误地引用了weight属性。但是,我不确定应该怎么做。

nx.shortest_path_length(G=g, source='c', target='f', weight="['attributes']['weight']")

任何帮助将不胜感激!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您使图形的创建过于复杂。您可以使用nx.from_pandas_edgelist以更简单的方式(包括边属性)从数据框创建图形,并找到最短路径长度,如下所示:

G = nx.from_pandas_edgelist(df, source='F', target='T', edge_attr=['weight','dummy'], 
                            create_using=nx.DiGraph)

G.edges(data=True)
# EdgeDataView([('a', 'b', {'weight': 1.2, 'dummy': 'q'}), 
#               ('b', 'c', {'weight': 5.2, 'dummy': 'w'})...

nx.shortest_path_length(G, source='c', target='f', weight='weight')
# 4.0

更仔细地研究您的方法,问题在于如何在nx.shortest_path_length中指定权重。当"['attributes']['weight']"参数设置为指定权重属性名称的字符串时,您正在使用weight。因此,在您的情况下,"weight"

因此,您将获得与以下相同的信息:

nx.shortest_path_length(G=g, source='c', target='f', weight=None)
# 2

您应该按照上面的步骤进行操作

nx.shortest_path_length(G, source='c', target='f', weight='weight')
# 4.0
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