Question

我需要逐个元素地粘贴两个数据帧的内容，以便输入到另一个程序。我有一个平均值的数据框和一个标准误差的数据框。

我尝试使用R paste（）函数，但它似乎无法处理数据框。当使用向量时，它似乎将第一个向量的所有元素连接成一个字符串，将第二个向量的所有元素连接成一个单独的字符串。相反，我需要将两个数据帧中的每个互惠元素连接在一起。

有关如何处理此问题的任何建议？我已经包含了虚拟输入数据（datMean和datSE）和我想要的输出（datNew）。我的实际数据框大小约为10行×150列。

# means and SEM
datMean <- data.frame(a=rnorm(10, 3), b=rnorm(10, 3), d=rnorm(10, 3))
datSE <- data.frame(a=rnorm(10, 3)/100, b=rnorm(10, 3)/100, d=rnorm(10, 3)/100)

# what the output should look like
# i've chosen some arbitrary values here, and show only the first row. 
datNew <- data.frame(a="2.889-2.926", b="1.342-1.389", d="2.569-2.576")

这个想法是针对datNew中的每个元素都是由'mean-se'和'mean + se'组成的范围，用短划线' - '分隔。 paste（）函数可以为一个元素执行此操作，如何在整个数据框中执行此操作？

paste(datMean[1,1] - datSE[1,1], datMean[1,1] + datSE[1,1], sep="-")

编辑1：看一些答案，我意识到我在问题中遗漏了一些重要的信息。原始数据帧的每一行都被命名，我需要用这些名称重建最终数据帧。例如：

rownames(datMean) <- LETTERS[1:10]
rownames(datSE) <- LETTERS[1:10]

我需要datNew最终再次拥有这10个rownames。对于一些使用melt（）的解决方案，这可能会有问题。

Answer 1

如果首先转换为矩阵，则可以完全不使用或循环。

MdatMean <- as.matrix(datMean)
MdatSE <- as.matrix(datSE)
matrix( paste(MdatMean - MdatSE, MdatMean + MdatSE, sep="-"), 
        nrow=nrow(MdatMean), dimnames=dimnames(MdatMean) )

您还可以考虑使用formatC来更好地进行格式化。

lo <- formatC(MdatMean - MdatSE, format="f", digits=3)
hi <- formatC(MdatMean + MdatSE, format="f", digits=3)
matrix( paste(lo, hi, sep="-"), 
        nrow=nrow(MdatMean), dimnames=dimnames(MdatMean) )

如果你想要data.frame，最后只需在as.data.frame中包裹最后一行。

Answer 2

这是一种在不手动指定每列的情况下执行此操作的方法。首先，我们使用abind包制作数据并将它们放入数组中，舍入为3，因为它看起来更好：

datMean <- data.frame(a=rnorm(10, 3), b=rnorm(10, 3), d=rnorm(10, 3))
datSE <- data.frame(a=rnorm(10, 3)/100, b=rnorm(10, 3)/100, d=rnorm(10, 3)/100)

library(abind)

datArray <- round(abind(datMean,datSE,along=3),3)

然后我们可以将paste函数应用于此数组的每个元素和列：

apply(datArray,1:2,function(x)paste(x[1]-x[2],"-",x[1]+x[2]))

      a               b               d              
 [1,] "3.537 - 3.581" "3.358 - 3.436" "3.282 - 3.312"
 [2,] "2.452 - 2.516" "1.372 - 1.44"  "3.041 - 3.127"
 [3,] "3.017 - 3.101" "3.14 - 3.228"  "5.238 - 5.258"
 [4,] "3.397 - 3.451" "2.783 - 2.839" "3.381 - 3.405"
 [5,] "1.918 - 1.988" "2.978 - 3.02"  "3.44 - 3.504" 
 [6,] "4.01 - 4.078"  "3.014 - 3.068" "1.914 - 1.954"
 [7,] "3.475 - 3.517" "2.117 - 2.159" "1.871 - 1.929"
 [8,] "2.551 - 2.619" "3.907 - 3.975" "1.588 - 1.614"
 [9,] "1.707 - 1.765" "2.63 - 2.678"  "1.316 - 1.348"
[10,] "4.051 - 4.103" "3.532 - 3.628" "3.235 - 3.287"

Answer 3

您可以一次对每一行执行此操作，但是您要应用于两个data.frame之间的成对列。由于每次都要执行特定的粘贴作业，因此请定义函数：

pfun <- function(x, y) paste(x - y, x + y, sep = "-")

然后使用函数

构造新的data.frame

 datNew <- data.frame(a = pfun(datMean$a, datSE$a), b = pfun(datMean$b, datSE$b), d = pfun(datMean$d, datSE$d))

有一些方法可以应用这个，但也许这有助于你更好地理解。您可以将整列传递给粘贴，但不能传递整个data.frames。

使用循环匹配结果中的所有列，而不单独指定它们。

首先创建一个列表来存储所有列，我们将转换为具有正确列名的data.frame。

datNew <- vector("list", ncol(datMean))

命名确实假设列号，名称和顺序是两个输入data.frames之间的完全匹配。

names(datNew) <- names(datMean)

for (i in 1:ncol(datMean)) {
    datNew[[i]] <- pfun(datMean[[i]], datSE[[i]])
}

转换为data.frame：

datNew <- as.data.frame(datNew)

Answer 4

以下是我理解您的问题的方法。我使用reshape2::melt将means和SE的数据从多列熔合到一列。

library(reshape2)
datMean <- melt(datMean)$value
datSE <- melt(datSE)$value
dat <- cbind(datMean, datSE)

apply(X = dat, MARGIN = 1, FUN = function(x) {
            paste(x[1] - x[2], x[1] + x[2], sep = " - ")
        })

结果

 [1] "3.03886802467251 - 3.08551547263516" 
 [2] "3.01803172559258 - 3.05247871975711" 
 [3] "3.4609230722069 - 3.56097173966387"  
 [4] "1.35368243309618 - 1.45548512578821" 
 [5] "2.39936853846605 - 2.47570756724791" 
 [6] "3.21849170272184 - 3.29653660329785"

修改的

此解决方案尊重您的原始数据维度。我所做的是制作一个3D数组并一次处理每个单元格，同时保持第三维（[x,y, 1:2]）不变。

dat <- array(c(datMean, datSE), dim = c(10, 3, 2))

datNEW <- matrix(rep(NA, nrow(dat)*ncol(dat)), ncol = ncol(dat))

for (column in seq(ncol(dat))) {
    cls <- rep(NA, nrow(dat))
    for (rows in seq(nrow(dat))) {
        tmp <- dat[rows, column, 1:2]
        cls[rows] <- paste(tmp[1] - tmp[2], tmp[1] + tmp[2], sep = " - ")
    }
    datNEW[, column] <- cls
}

在R中逐个元素地粘贴两个数据帧

4 个答案: