Question

我希望在服务器上执行虚拟环境来运行我的分析。这些分析需要很多时间（最少3天）。所以我想使用nohup来运行我的命令。

source activate qiime2-2019.1    
nohup qiime feature-classifier classify-consensus-vsearch \
        --i-query OTU-marion.qza \
        --i-reference-reads CO1-midori-20180221-seqs.qza \
        --i-reference-taxonomy CO1-midori-20180221-taxo.qza \
        --p-perc-identity 0.97 \
        --p-min-consensus 0.85 \
        --o-classification 5-classify-OTU-marion-vsearch.qza &

但是我无法使用nohup执行我的虚拟环境，并且当我关闭服务器提示符时，我的命令中止了...

nohup source activate qiime2-2019.1  
                               
nohup: inputs are ignored and output is appended to 'nohup.out'
nohup: cannot execute command 'source': No file or folder of this type

有人知道我该怎么做吗？谢谢马里恩

Answer 1

Blusky的解决方案似乎有效！

您是否曾尝试将qiim命令的source Activate命令放入同一bash脚本中，并尝试不对bash脚本进行hup

用nohup执行虚拟环境

1 个答案: