这是典型的输入.txt
文件(也称为fasta文件):
>contig00001 length=586 numreads=4 CGGGAAATTATCcGCGCCTTCACCGCCGCCGGTTCCACCGACGAACGGATACTGCGtGaa ggCCGCGATCCCGTCggaCGGAAAaCGCCcTGGCCCGGGAaCATACCGTTCGGGCCGCCA AGTGTTATAGCCGGACCACTTGTCAGAACATTTCCaaTCCGAAGATGTGAGTtCGGAAGg TAAAAGCCCGACAAGTTGCGCGgTGAATTTACCTTtACcGCACGATATGCGTCCGTATTA AaGAAAaGTTCGAAATTATCAGTAAGGCCGACCTGAAaGCTGACCGGGAGTTCAACAAAA TCTGCATCACCcGGgTCACGGTCGAAATTGCTGTACGCGGCGCTGAACGTAAATTCACCC TTTcTAAGGGTGTCGCcGTCGTAAACCGTAAaCAaGCCGGTAGCGCCGCCCATCGGGCCG CCGGTACCAACCGTCGGTGCCGTGTTTCTtGCATCATTGTCCGATCGAGCGTTCTCGTCC GCTTGTGCAAaTCCTGCAaTAGCTAACGTGAAAACGATCAGAGCTGTTGTAAATACTCTA TAAGCGAGATTCATCACATTCCTCcGCCGAAATAAAAAGTTAATTt >contig00002 length=554 numreads=4 TGCGCCAaCCGCGCTCTtCATAAaTGGGCACTGCTCCCGATGGCCgACTCGGGCGGTTCG CCATGAGATCTTTGCCtACCcAGgAaCtCACcACCAAGTCTGATTGCTGTGTGTTTtCTT CAAGTCCCTATTTCTATTCtCTTtAATGGAACCCGTAGGAAACCCGTGTAGGACGCGGGA aCCGCACTTgAAGGGGGAGGCGCGGGGTACCGGtCCGGGAACGTACGGGTACCGGCGGGG gAGGGGAGGGGGACCgCTCCGGGAAGGCCAGGGGACGGATTGGGGAAGGgCGGGTACCGA AGCGGGgAAaTGGGggAaCcGGCGAGAGGGTTCCTCGCTAAGTGGGGGAAATaGGGGAAA GGTTGACCAGTGGTtCCCcGCTCTCGTAACATGCCTCAGATAGCGCCATCCGCTGTACCT GGtcaggtcGctggcaacttcggccgagcaggtgaacccgaaaggtgagggtcagtgtga cacaccaaccgaacaccgacgaggcaagcgtaggagccggcgtggccgcgcccggcggcg ctgaggactcctcg
可以找到读取序列的代码here。
它给出了正确的输出,如下面的标签分隔所示:
contig00001 586 52.38
contig00002 554 62.45
问题是我在NetBeans中开发了一个由JTable
组成的表,其中有5列,即:
"contigID","Description","Organism","Sequence_length","Gc_percentage"
和JTextArea
。我想在JTable
列中显示上述输出,而其他列保持为空;当我点击JTable
中的'contig00001'时,{CGIGAAAT ......'中的相应序列应显示在JTextArea
中。
我该怎么做?任何建议都将不胜感激。
答案 0 :(得分:1)
一种方法是扩展AbstractTableModel
,如Creating a Table Model中所述。
附录:通过聆听user selection,您可以确定选择了哪一行并相应地更新JTextArea
。
附录:由于数据检索可能会受到影响,SwingWorker
提供了一种安全的方式来改变TableModel
。这是一个简单的example。
答案 1 :(得分:1)
我不确定你坚持的是什么。如果它正在向JTable添加数据,我会考虑创建一个DefaultTableModel对象,使用数组中正确的列标题字符串构造它,包含0行数据,然后在读取文件时添加数据行。 JTable教程应该可以帮助您完成所有这些工作。创建表模型后,可以通过setModel方法轻松将其添加到JTable中。