我以前使用下面的类似代码创建了一个docker容器,但是我运行了一个基本的python脚本来打印“ Hello”。我试图在R中执行RNASeq,并在尝试运行代码时遇到问题。
这就是我的Dockerfile中的内容。
FROM debian:stretch-slim
RUN apt-get update \
&& apt-get install -y --no-install-recommends r-base r-base-dev git python3 \
&& apt-get clean
COPY file.R /
在我的终端上,我跑了:
docker build -t username/python_git_r_hello .
此命令运行成功,但是当我跟进时:
docker run -it username/python_git_r_hello:latest r-base file.R
我遇到以下错误:docker:
Error response from daemon: OCI runtime create failed: container_linux.go:349: starting container process caused "exec: \"r-base\": executable file not found in $PATH": unknown.
ERRO[0000] error waiting for container: context canceled
请帮助,我是使用docker的新手。
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可执行文件名为R
,而不是r-base
。运行:
docker run -it username/python_git_r_hello:latest R file.R