叶绿素图中的离散颜色不会显示所有级别

时间:2020-08-30 18:16:46

标签: r maps plotly r-plotly

我正在尝试绘制哥伦比亚省份地图和具有8个等级的因子变量,我正在使用经纬度坐标。

我的数据框如下:

> head(df[,c('CODMPIO','Esc2a','Longitud','Latitud')])
# A tibble: 6 x 4
  CODMPIO Esc2a Longitud Latitud
  <chr>   <fct>    <dbl>   <dbl>
1 05001   4        -75.6    6.25
2 05002   5        -75.4    5.79
3 05004   7        -76.1    6.63
4 05021   5        -75.1    6.38
5 05030   7        -75.7    6.04
6 05031   7        -75.1    6.91

并且geojson具有坐标和这些列:

$properties
$properties$DPTOMPIO
[1] "05001"

$properties$DPTO_CCDGO
[1] "05"

$properties$MPIO_CCDGO
[1] "001"

$properties$MPIO_CNMBR
[1] "MEDELLÍN"

$properties$MPIO_CCNCT
[1] "05001"

properties $ DPTOMPIO

相同

df $ CODMPIO

最后,我所有的代码就是这个

df$Esc2a = factor(df$Esc2a)
df$test = as.numeric(df$Esc2a)
nfactor = length(levels(df$Esc2a))
foo <- brewer.pal(n = nfactor,name = "Set1")
names(foo) = levels(df$Esc2a)

Z_Breaks = function(n){
  CUTS = seq(0,1,length.out=n+1)
  rep(CUTS,ifelse(CUTS %in% 0:1,1,2))
}

colorScale <- data.frame(z=Z_Breaks(nfactor),
                         col=rep(foo,each=2),stringsAsFactors=FALSE)


g <- list(
  fitbounds = "locations",
  visible = FALSE
)
fig <- plot_ly() 
fig <- fig %>% add_trace(
  data=df,
  type="choropleth",
  geojson=geojson,
  locations= ~CODMPIO,
  z=df$test,
  colorscale=colorScale,
  colorbar=list(tickvals=1:nfactor, ticktext=names(foo)),
  featureidkey="properties.DPTOMPIO"
)
fig <- fig %>% layout(
  geo = g
)
fig

第一行使用的是对此问题How to create a chloropleth map in R Plotly based on a Categorical variable?的答案

我得到以下情节

Resulting plot

它正确地对因素进行了分类,当我将鼠标悬停在上面时,它会向我显示正确的值和正确的ID,但是如您所见,它没有着色,因为它应该只对最后一行进行正确的着色(绿色)

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