使数据集适合正态分布的混合

时间:2020-08-14 11:24:46

标签: python scipy statistics statsmodels scipy.stats

在我的应用程序中,输入数据集通常来自高斯分布。但是,有时它是多峰的,在这种情况下,我想将数据建模为来自多个高斯分布的数据的混合。

现在,我想对许多基础分布的均值和西格玛进行估算。

我找不到办法。

我想的一种方法是将数据集分成多个。我将使用高斯KDE并将最小值作为分割点。但是,在基础分布重叠的区域中,这将是不准确的。

还有更好的方法吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

为了将来:https://stats.stackexchange.com/将是一个更适合统计问题的地方。

无需将数据集分成多个。看起来scipy已经涵盖了:https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/tutorial/stats.html,如果您查看内核密度估计和双峰分布版本

def my_kde_bandwidth(obj, fac=1./5):
    """We use Scott's Rule, multiplied by a constant factor."""
    return np.power(obj.n, -1./(obj.d+4)) * fac

from functools import partial


loc1, scale1, size1 = (-2, 1, 175)

loc2, scale2, size2 = (2, 0.2, 50)

x2 = np.concatenate([np.random.normal(loc=loc1, scale=scale1, size=size1),

                     np.random.normal(loc=loc2, scale=scale2, size=size2)])


x_eval = np.linspace(x2.min() - 1, x2.max() + 1, 500)


kde = stats.gaussian_kde(x2)

kde2 = stats.gaussian_kde(x2, bw_method='silverman')

kde3 = stats.gaussian_kde(x2, bw_method=partial(my_kde_bandwidth, fac=0.2))

kde4 = stats.gaussian_kde(x2, bw_method=partial(my_kde_bandwidth, fac=0.5))


pdf = stats.norm.pdf

bimodal_pdf = pdf(x_eval, loc=loc1, scale=scale1) * float(size1) / x2.size + \

              pdf(x_eval, loc=loc2, scale=scale2) * float(size2) / x2.size



fig = plt.figure(figsize=(8, 6))

ax = fig.add_subplot(111)



ax.plot(x2, np.zeros(x2.shape), 'b+', ms=12)

ax.plot(x_eval, kde(x_eval), 'k-', label="Scott's Rule")

ax.plot(x_eval, kde2(x_eval), 'b-', label="Silverman's Rule")

ax.plot(x_eval, kde3(x_eval), 'g-', label="Scott * 0.2")

ax.plot(x_eval, kde4(x_eval), 'c-', label="Scott * 0.5")

ax.plot(x_eval, bimodal_pdf, 'r--', label="Actual PDF")



ax.set_xlim([x_eval.min(), x_eval.max()])

ax.legend(loc=2)

ax.set_xlabel('x')

ax.set_ylabel('Density')

plt.show()

Resulting image

这里x2是建模数据,...也许在文档页面中有更好的解释。

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