Question

嗨，我正在尝试所有可能的更改以读取以下json字符串，但仍然出现以下错误，我的json是有效的字符串，并且问题是子元素的映射存在问题

这是我的json字符串

[
    {
        "denotations": [
            {
                "id": [
                    "CUI-less"
                ],
                "obj": "disease",
                "span": {
                    "begin": 31,
                    "end": 41
                }
            }
        ],
        "elapsed_time": {
            "ner": 2.759,
            "normalization": 0.002,
            "tmtool": 0.148,
            "total": 2.91
        },
        "logits": {
            "disease": [
                [
                    {
                        "end": 41,
                        "id": "CUI-less",
                        "start": 31
                    },
                    0.999957799911499
                ]
            ],
            "drug": [],
            "gene": [],
            "species": []
        },
        "project": "BERN",
        "sourcedb": "PubMed",
        "sourceid": "2832773",
        "text": "Absence of humoral immunity to poliovirus in vaccinated individuals.",
        "timestamp": "Thu Aug 06 13:42:27 +0000 2020"
    }
]

我的java pojo（Logit的类）

import java.util.HashMap;
import java.util.List;
import java.util.Map;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonAnyGetter;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonAnySetter;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonIgnore;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonInclude;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonProperty;
import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonPropertyOrder;

@JsonInclude(JsonInclude.Include.NON_NULL)
@JsonPropertyOrder({
    "disease",
    "drug",
    "gene",
    "species"
})
public class Logits {

    @JsonProperty("disease")
    private List<List<Disease>> disease = null;
    @JsonProperty("drug")
    private List<Object> drug = null;
    @JsonProperty("gene")
    private List<Object> gene = null;
    @JsonProperty("species")
    private List<Object> species = null;
    @JsonIgnore
    private Map<String, Object> additionalProperties = new HashMap<String, Object>();

    @JsonProperty("disease")
    public List<List<Disease>> getDisease() {
        return disease;
    }

    @JsonProperty("disease")
    public void setDisease(List<List<Disease>> disease) {
        this.disease = disease;
    }

    @JsonProperty("drug")
    public List<Object> getDrug() {
        return drug;
    }

    @JsonProperty("drug")
    public void setDrug(List<Object> drug) {
        this.drug = drug;
    }

    @JsonProperty("gene")
    public List<Object> getGene() {
        return gene;
    }

    @JsonProperty("gene")
    public void setGene(List<Object> gene) {
        this.gene = gene;
    }

    @JsonProperty("species")
    public List<Object> getSpecies() {
        return species;
    }

    @JsonProperty("species")
    public void setSpecies(List<Object> species) {
        this.species = species;
    }

    @JsonAnyGetter
    public Map<String, Object> getAdditionalProperties() {
        return this.additionalProperties;
    }

    @JsonAnySetter
    public void setAdditionalProperty(String name, Object value) {
        this.additionalProperties.put(name, value);
    }

}

即使尝试过String [] []疾病仍然无法解析，请让我知道我在这里想念的东西

解析代码

 String denotations = restTemplate.getForObject("http://com/text",String.class);
       System.out.println(denotations);
       ObjectMapper mapper = new ObjectMapper();
       BernOBJ denoObj = mapper.readValue(denotations, BernOBJ.class);
       System.out.println(denoObj);

Stacktrace

com.fasterxml.jackson.databind.exc.MismatchedInputException：无法将com.goodyzain.bern.models.BernOBJ的实例反序列化 START_ARRAY令牌位于[来源：（字符串）” [ { “符号”：[ { “ID”： [ “无CUI” ]， “ obj”：“疾病”， “跨度”： { “开始”：31， “结束”：41 } } ]， “ elapsed_time”：{ “ ner”：2.759， “归一化”：0.002， “ tmtool”：0.148， “总计”：2.91 }， “登录”：{ “疾病”： [ “ [被截断的555个字符]；行：1，列：1]位于com.fasterxml.jackson.databind.exc.MismatchedInputException.from（MismatchedInputException.java:59）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]，网址为 com.fasterxml.jackson.databind.DeserializationContext.reportInputMismatch（DeserializationContext.java:1468）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]，网址为 com.fasterxml.jackson.databind.DeserializationContext.handleUnexpectedToken（DeserializationContext.java:1242）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]，网址为 com.fasterxml.jackson.databind.DeserializationContext.handleUnexpectedToken（DeserializationContext.java:1190）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]，网址为 com.fasterxml.jackson.databind.deser.BeanDeserializer._deserializeFromArray（BeanDeserializer.java:604）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]，网址为 com.fasterxml.jackson.databind.deser.BeanDeserializer._deserializeOther（BeanDeserializer.java:190）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]，网址为 com.fasterxml.jackson.databind.deser.BeanDeserializer.deserialize（BeanDeserializer.java:166）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]，网址为 com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper._readMapAndClose（ObjectMapper.java:4482）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]，网址为 com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper.readValue（ObjectMapper.java:3434）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]，网址为 com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper.readValue（ObjectMapper.java:3402）〜[jackson-databind-2.11.1.jar：2.11.1]，网址为 com.goodyzain.bern.BernAPIController.getUsersById（BernAPIController.java:41）〜[classes /：na]在sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0（本机方法）〜[na：1.8.0_252]在 sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke（NativeMethodAccessorImpl.java:62）〜[na：1.8.0_252]在 sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke（DelegatingMethodAccessorImpl.java:43）〜[na：1.8.0_252]在java.lang.reflect.Method.invoke（Method.java:498）〜[na：1.8.0_252]在 org.springframework.web.method.support.InvocableHandlerMethod.doInvoke（InvocableHandlerMethod.java:190）〜[spring-web-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.method.support.InvocableHandlerMethod.invokeForRequest（InvocableHandlerMethod.java:138）〜[spring-web-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.servlet.mvc.method.annotation.ServletInvocableHandlerMethod.invokeAndHandle（ServletInvocableHandlerMethod.java:105）〜[spring-webmvc-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.servlet.mvc.method.annotation.RequestMappingHandlerAdapter.invokeHandlerMethod（RequestMappingHandlerAdapter.java:878）〜[spring-webmvc-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.servlet.mvc.method.annotation.RequestMappingHandlerAdapter.handleInternal（RequestMappingHandlerAdapter.java:792）〜[spring-webmvc-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.servlet.mvc.method.AbstractHandlerMethodAdapter.handle（AbstractHandlerMethodAdapter.java:87）〜[spring-webmvc-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.servlet.DispatcherServlet.doDispatch（DispatcherServlet.java:1040）〜[spring-webmvc-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.servlet.DispatcherServlet.doService（DispatcherServlet.java:943）〜[spring-webmvc-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.servlet.FrameworkServlet.processRequest（FrameworkServlet.java:1006）〜[spring-webmvc-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.servlet.FrameworkServlet.doGet（FrameworkServlet.java:898）〜[spring-webmvc-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 javax.servlet.http.HttpServlet.service（HttpServlet.java:626）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：4.0.FR]在 org.springframework.web.servlet.FrameworkServlet.service（FrameworkServlet.java:883）〜[spring-webmvc-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 javax.servlet.http.HttpServlet.service（HttpServlet.java:733）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：4.0.FR]在 org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter（ApplicationFilterChain.java:231）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter（ApplicationFilterChain.java:166）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.tomcat.websocket.server.WsFilter.doFilter（WsFilter.java:53）〜[tomcat-embed-websocket-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter（ApplicationFilterChain.java:193）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter（ApplicationFilterChain.java:166）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.springframework.web.filter.RequestContextFilter.doFilterInternal（RequestContextFilter.java:100）〜[spring-web-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.filter.OncePerRequestFilter.doFilter（OncePerRequestFilter.java:119）〜[spring-web-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter（ApplicationFilterChain.java:193）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter（ApplicationFilterChain.java:166）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.springframework.web.filter.FormContentFilter.doFilterInternal（FormContentFilter.java:93）〜[spring-web-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.filter.OncePerRequestFilter.doFilter（OncePerRequestFilter.java:119）〜[spring-web-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter（ApplicationFilterChain.java:193）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter（ApplicationFilterChain.java:166）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.springframework.web.filter.CharacterEncodingFilter.doFilterInternal（CharacterEncodingFilter.java:201）〜[spring-web-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.springframework.web.filter.OncePerRequestFilter.doFilter（OncePerRequestFilter.java:119）〜[spring-web-5.2.8.RELEASE.jar：5.2.8.RELEASE]在 org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter（ApplicationFilterChain.java:193）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter（ApplicationFilterChain.java:166）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.core.StandardWrapperValve.invoke（StandardWrapperValve.java:202）〜[tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.core.StandardContextValve.invoke（StandardContextValve.java:96） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.authenticator.AuthenticatorBase.invoke（AuthenticatorBase.java:541） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.core.StandardHostValve.invoke（StandardHostValve.java:139） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.valves.ErrorReportValve.invoke（ErrorReportValve.java:92） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.core.StandardEngineValve.invoke（StandardEngineValve.java:74） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.catalina.connector.CoyoteAdapter.service（CoyoteAdapter.java:343） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.coyote.http11.Http11Processor.service（Http11Processor.java:373） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.coyote.AbstractProcessorLight.process（AbstractProcessorLight.java:65） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.coyote.AbstractProtocol $ ConnectionHandler.process（AbstractProtocol.java:868） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.tomcat.util.net.NioEndpoint $ SocketProcessor.doRun（NioEndpoint.java:1589） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 org.apache.tomcat.util.net.SocketProcessorBase.run（SocketProcessorBase.java:49） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker（ThreadPoolExecutor.java:1149） [na：1.8.0_252]在 java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor $ Worker.run（ThreadPoolExecutor.java:624） [na：1.8.0_252]在 org.apache.tomcat.util.threads.TaskThread $ WrappingRunnable.run（TaskThread.java:61） [tomcat-embed-core-9.0.37.jar：9.0.37]在 java.lang.Thread.run（Thread.java:748）[na：1.8.0_252]

Answer 1

您当前遇到的错误：

Cannot deserialize instance of com.goodyzain.bern.models.BernOBJ out of START_ARRAY token at [Source: (String)"[ {

表示您具有对象的JSON数组（以[{...开头），但是尝试将其解析为单个对象：

BernOBJ denoObj = mapper.readValue(denotations, BernOBJ.class);

通常应该将数组解析为值列表，例如像这样：

List<BernOBJ> denoObj = mapper.readValue(denotations, 
  mapper.getTypeFactory().constructCollectionType(List.class, BernObj.class));

此外，您的List<List<Disease>>列表并不完全包含Disease个对象，它包含一个对象和一个double值：

[
    [
        {
            "end": 41,
            "id": "CUI-less",
            "start": 31
        },
        0.999957799911499
    ]
]

我不确定那里是否总是有一个对象和一个数值，以及它的含义，但是您可以执行以下操作。创建一个附加的类，例如DiseasePair，并按以下方式映射它：

@JsonFormat(shape = JsonFormat.Shape.ARRAY)
@JsonPropertyOrder({ "disease", "numericValue" })
class DiseasePair {

    private Disease;

    private Double numericValue;

}

然后将您的List<List<Disease>>字段类型更改为List<DiseasePair>。

com.fasterxml.jackson.databind.exc.MismatchedInputException：无法反序列化实例吗？

1 个答案: