我有两个矩阵,我需要对行名和列名进行匹配才能进行逐个元素的计算。第一个计算是phij / pij,第二个计算是((phij-pij)^ 2)/ pij 长矩阵phij的行名用短划线隔开,例如Aaa- Baa 。列名没有破折号。我需要将破折号后的行名部分(即 Baa )和phij矩阵中的列名与较小的矩阵pij的行名和列名进行匹配。
我尝试使用for循环,但它与实际的行名和列名不匹配,而是在序列中查找位置。
.svgfilter {
width: 1em;
height: 1em;
margin-bottom: -2px;
filter: invert(100%);
}
数据:
phij:
LR<-phij
ChiSq<-phij
ROWS <- data.frame(ROW0=rownames(phij),
ROW1=substr(rownames(phij),regexpr("-", rownames(phij))+1,nchar(rownames(phij))))
COLNAMES <- c(colnames(phij))
for(rowN in 1:length(ROWS$ROW0)){
for(colN in COLNAMES){
LR[ROWS$ROW0[rowN],colN]<-LR[ROWS$ROW0[rowN],colN]/pij[ROWS$ROW1[rowN],colN]
ChiSq[ROWS$ROW0[rowN],colN]<-((ChiSq[ROWS$ROW0[rowN],colN]-pij[ROWS$ROW1[rowN],colN])^2)/pij[ROWS$ROW1[rowN],colN]
}
}
pij:
structure(c(0.111111111111111, 0.2, 0, 0, 0, 0.25, 0, 0.666666666666667,
0.166666666666667, 0, 0, 0.666666666666667, 0.5, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.4, 0.333333333333333, 0, 1,
0, 0.166666666666667, 0, 0.571428571428571, 0, 0, 0, 0.4, 0.272727272727273,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.222222222222222, 0.6, 0, 0, 0.25, 0,
0, 0.333333333333333, 0.333333333333333, 0, 0, 0.333333333333333,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0.2, 0.666666666666667,
0, 0, 0, 0.166666666666667, 0, 0.142857142857143, 1, 0, 0, 0.2,
0.272727272727273, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.25, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.2,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.222222222222222, 0.2, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0.166666666666667, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.2, 0, 0, 0, 0, 0.333333333333333, 0, 0.142857142857143,
0, 0, 0, 0.2, 0.181818181818182, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.444444444444444,
0, 0, 0, 0.75, 0.5, 0, 0, 0.333333333333333, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0.2, 0, 0, 0, 1, 0.333333333333333,
0, 0.142857142857143, 0, 0, 1, 0, 0.272727272727273, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0), class = "table", .Dim = c(49L,
7L), .Dimnames = list(i = c("A-A", "A-Aa", "A-Aaa", "A-B", "A-Ba",
"A-Baa", "A-Caa", "Aa-A", "Aa-Aa", "Aa-Aaa", "Aa-B", "Aa-Ba",
"Aa-Baa", "Aa-Caa", "Aaa-A", "Aaa-Aa", "Aaa-Aaa", "Aaa-B", "Aaa-Ba",
"Aaa-Baa", "Aaa-Caa", "B-A", "B-Aa", "B-Aaa", "B-B", "B-Ba",
"B-Baa", "B-Caa", "Ba-A", "Ba-Aa", "Ba-Aaa", "Ba-B", "Ba-Ba",
"Ba-Baa", "Ba-Caa", "Baa-A", "Baa-Aa", "Baa-Aaa", "Baa-B", "Baa-Ba",
"Baa-Baa", "Baa-Caa", "Caa-A", "Caa-Aa", "Caa-Aaa", "Caa-B",
"Caa-Ba", "Caa-Baa", "Caa-Caa"), j = c("A", "Aa", "Aaa", "B",
"Ba", "Baa", "Caa")))
答案 0 :(得分:1)
您可以创建一个新的pij
矩阵,该矩阵的尺寸与phij
相同,然后执行所需的计算。
new_pij <- pij[sub('-.*', '', rownames(phij)), colnames(phij)]
然后您可以执行以下操作:
phij/new_pij
和
((phij-new_pij)^2)/new_pij