熊猫应用于多列滚动输出

时间:2020-07-03 13:34:20

标签: python pandas dataframe rolling-computation

我正在研究将滚动窗口应用于将返回多列的函数的代码。

输入:熊猫系列
预期输出:3列DataFrame

def fun1(series, ):
    # Some calculations producing numbers a, b and c
    return {"a": a, "b": b, "c": c} 

res.rolling('21 D').apply(fun1)

res的内容:

time
2019-09-26 16:00:00    0.674969
2019-09-26 16:15:00    0.249569
2019-09-26 16:30:00   -0.529949
2019-09-26 16:45:00   -0.247077
2019-09-26 17:00:00    0.390827
                         ...   
2019-10-17 22:45:00    0.232998
2019-10-17 23:00:00    0.590827
2019-10-17 23:15:00    0.768991
2019-10-17 23:30:00    0.142661
2019-10-17 23:45:00   -0.555284
Length: 1830, dtype: float64

错误:

TypeError: must be real number, not dict

我尝试过的事情:

  • 更改raw =正确应用
  • 在apply中使用lambda函数
  • 将fun1中的结果作为列表/ numpy数组/ dataframe /系列返回。

我还阅读了SO中的许多相关文章,并指出了以下几点:

但是指定的解决方案都不能解决这个问题。

对此有直接解决方案吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

此技巧似乎对我有用,尽管滚动的其他功能无法应用于此解决方案。但是,由于进行了多处理,因此应用程序的速度明显更快。

from multiprocessing import Pool
import functools


def apply_fn(indices, fn, df):
    return fn(df.loc[indices])
              
    
def rolling_apply(df, fn, window_size, start=None, end=None):
    """
    The rolling application of a function fn on a DataFrame df given the window_size
    """
    x = df.index
    if start is not None:
        x = x[x >= start]
    if end is not None:
        x = x[x <= end]
    if type(window_size) == str:
        delta = pd.Timedelta(window_size)
        index_sets = [x[(x > (i - delta)) & (x <= i)] for i in x]
    else: 
        assert type(window_size) == int, "Window size should be str (representing Timedelta) or int"
        delta = window_size
        index_sets = [x[(x > (i - delta)) & (x <= i)] for i in x]
    
    with Pool() as pool:
        result = list(pool.map(functools.partial(apply_fn, fn=fn, df=df), index_sets))
    result = pd.DataFrame(data=result, index=x)
        
    return result

具备上述功能后,插入功能即可滚动到自定义rolling_function中。

result = rolling_apply(res, fun1, "21 D")

结果内容:

                    a           b           c
time            
2019-09-26 16:00:00 NaN         NaN         NaN
2019-09-26 16:15:00 0.500000    0.106350    0.196394
2019-09-26 16:30:00 0.500000    0.389759    -0.724829
2019-09-26 16:45:00 2.000000    0.141436    -0.529949
2019-09-26 17:00:00 6.010184    0.141436    -0.459231
... ... ... ...
2019-10-17 22:45:00 4.864015    0.204483    -0.761609
2019-10-17 23:00:00 6.607717    0.204647    -0.761421
2019-10-17 23:15:00 7.466364    0.204932    -0.761108
2019-10-17 23:30:00 4.412779    0.204644    -0.760386
2019-10-17 23:45:00 0.998308    0.203039    -0.757979
1830 rows × 3 columns

注意:

  • 此实现适用于Series和DataFrame输入
  • 此实现适用于时间窗口和整数窗口
  • fun1返回的结果甚至可以是列表,numpy数组,系列或字典
  • window_size仅考虑最大窗口大小,因此window_size以下的所有起始索引将使其窗口包含直到起始元素的所有元素。
  • apply函数不应嵌套在rolling_apply函数内部,因为pool.map无法接受本地函数或lambda函数,因为根据multiprocessing库,它们不能被“腌制”

答案 1 :(得分:0)

以下是使用rolling hacky 答案,产生了一个DataFrame:

import pandas as pd
import numpy as np

dr = pd.date_range('09-26-2019', '10-17-2019', freq='15T')
data = np.random.rand(len(dr))

s = pd.Series(data, index=dr)

output = pd.DataFrame(columns=['a','b','c'])

row = 0

def compute(window, df):
    global row
    a = window.max()
    b = window.min()
    c = a - b
    df.loc[row,['a','b','c']] = [a,b,c]
    row+=1    
    return 1
    
s.rolling('1D').apply(compute,kwargs={'df':output})

output.index = s.index

似乎rolling apply函数总是希望返回一个数字,以便根据计算立即生成新的Series。

我通过创建一个新的output DataFrame(具有所需的输出列)并在函数中写入它来解决此问题。我不确定是否有办法在滚动对象中获取索引,所以我改用global来增加写入新行的次数。根据以上几点,您需要return一些数字。因此,尽管实际的rolling操作返回了一系列1,但output被修改了:

In[0]:
s

Out[0]:
2019-09-26 00:00:00    0.106208
2019-09-26 00:15:00    0.979709
2019-09-26 00:30:00    0.748573
2019-09-26 00:45:00    0.702593
2019-09-26 01:00:00    0.617028
  
2019-10-16 23:00:00    0.742230
2019-10-16 23:15:00    0.729797
2019-10-16 23:30:00    0.094662
2019-10-16 23:45:00    0.967469
2019-10-17 00:00:00    0.455361
Freq: 15T, Length: 2017, dtype: float64

In[1]:
output

Out[1]:
                           a         b         c
2019-09-26 00:00:00  0.106208  0.106208  0.000000
2019-09-26 00:15:00  0.979709  0.106208  0.873501
2019-09-26 00:30:00  0.979709  0.106208  0.873501
2019-09-26 00:45:00  0.979709  0.106208  0.873501
2019-09-26 01:00:00  0.979709  0.106208  0.873501
                      ...       ...       ...
2019-10-16 23:00:00  0.980544  0.022601  0.957943
2019-10-16 23:15:00  0.980544  0.022601  0.957943
2019-10-16 23:30:00  0.980544  0.022601  0.957943
2019-10-16 23:45:00  0.980544  0.022601  0.957943
2019-10-17 00:00:00  0.980544  0.022601  0.957943

[2017 rows x 3 columns]

这感觉更像是对rolling的利用,而不是预期的用途,因此,我希望看到一个更优雅的答案。

更新:感谢@JuanPi,您可以使用this answer获取滚动窗口索引。因此,非global答案可能看起来像这样:

def compute(window, df):
    a = window.max()
    b = window.min()
    c = a - b
    df.loc[window.index.max(),['a','b','c']] = [a,b,c]  
    return 1