有没有一种方法可以将自定义文本插入heatmap.2？

Question

我正在使用 heatmap.2 制作热图。有时我想在一个单元格元素中插入一个星号，以指示该元素具有统计意义。在另一个程序中已计算出重要性。是否可以将自定义文本或图形元素（星号）插入 heatmap.2 热图？

Answer 1

您可以使用cellnote的自变量heatmap.2（字符串矩阵，将放置在每个颜色单元中，例如p值符号）。

library(gplots)

# A 4 x 4 matrix
x <- as.matrix(dist(t(iris[,-5])))

# A 4 x 4 matrix of characters (stars)
labs <- matrix("",4,4)
labs[2,3] <- labs[1,4] <- "*"

# How to use cellnote
p <- heatmap.2(x, cexRow=.8, cexCol=.8, 
               cellnote=labs, notecol="black", notecex=10)