根据另一个数据框从数据框中提取行

Question

我正在尝试根据另一个包含我感兴趣的基因列表的数据矩阵，从大型数据集中提取一组基因（行名）。我已经读到我应该使用filter和％in％命令，但是不确定如何正确编写它。

示例： 我的大型数据库：

Gene        Week1         Week 2.        Week 3
A.           20.           14.            5
B.           5.            10.            15
C.           2.            4.             6
D.           20.           18.            19

我的小型数据库：

Gene
A
C
D

我希望我的结果是：

Gene        Week1         Week 2.        Week 3
A.           20.           14.            5
C.           2.            4.             6
D.           20.           18.            19

有人可以帮忙吗？对于这个非常简单的问题，我深表歉意，也深表歉意:)

Answer 1

使用逻辑行索引：

large_database[large_database$Gene %in% unique(small_data_base$Gene), ]

说明：

large_database$Gene %in% unique(small_data_base$Gene)

检查large_database$Gene中的每个条目（即行）是否出现在unique(small_database$Gene)中，即Gene的列small_data_base中的唯一值列表，并返回布尔值向量（TRUE和FALSE的向量）。

然后我们可以将此向量用作行“索引”，以仅选择向量为TRUE的行（即large_database$Gene的值位于unique(small_database$Gene)