Question

我在遇到有关python脚本的问题。我在机器上使用Ubuntu作为第二个操作系统，并且编写了python代码以输出有关某些蛋白质的不同信息。在给我第一个蛋白质的输出后，它会在第二个蛋白质的过程中减慢速度，直到某个时候它不再响应。当我键入control + c时，我收到以下消息：

func (u *Apple) AfterFind() (err error) {
  u.Front= "https://www.example.com/"+ u.Front
  u.Back= "https://www.example.com/"+ u.Back
  u.Top= "https://www.example.com/"+ u.Top
  return
}

停止时的代码部分如下：

Traceback (most recent call last):
File "testPerf.py", line 185, in <module>
uniqueDict(args.input,args.output)

File "testPerf.py", line 73, in uniqueDict

keyName = '%s_%s' %(hmm[i],cassetteId[i])

File "/home/t/anaconda3/envs/crispr-env/lib/python3.7/site-packages/pandas/core/series.py",
line 1071, in __getitem__

result = self.index.get_value(self, key)

File "/home/t/anaconda3/envs/crispr-env/lib/python3.7/site-packages/pandas/core/indexes>>/base.py", line 4708, in get_value

s = getattr(series, "_values", series)

File "/home/t/anaconda3/envs/crispr-env/lib/python3.7/site-packages/pandas/core/series.py", line 562, in _values

这是一段代码，它从名为crisprOutputFile的文件中读取内容，并尝试在字典中输出一些数据，非常容易... 然后，将此字典与其他一些字典结合在一起，以提供包含有关蛋白质数据的输出字典。请帮助。

Answer 1

在给定的代码段中，如果在keyName中找到dict1，则i不会递增。如果i保持不变，则当前迭代将与先前的迭代相同，因此它将成为无限循环。

如果您实际上打算在每次迭代中更新i（这更有意义），请像这样降低i+=1的集成级别

with open(crisprOutputFile, "r") as file1:
            data = pd.read_csv(file1)
            hmm  = data.HMM
            cassetteId = data.cassette_id
            list1 = data.predicted_label
            i = 0
            while i < len(hmm):
                predictedL = list1[i][7:20]
                predictedL =  predictedL.replace( ')','')
                predictedL =  predictedL.replace( ']','')
                predictedL =  predictedL.replace( "'","")
                predictedL =  predictedL.replace( ',','')
                keyName = '%s_%s' %(hmm[i],cassetteId[i])
                if keyName not in dict1:
                    dict1[keyName] = predictedL
                i+=1

如@ run-out在评论中所建议，我建议您使用for循环。

1分钟后python脚本停止在终端上运行

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