将单变量coxph函数应用于多个协变量

时间:2020-05-21 12:37:39

标签: r cox-regression

对于我的数据集列,我有时间,状态,治疗,性别,BMI。我正在尝试将单变量coxph函数与协变量Treatment,Gender和BMI一起应用。

这是我的代码:

univ_models <- lapply( univ_formulas, function(x){coxph(x, data = RemissionTimes)})
univ_results <- lapply(univ_models,
                       function(x){ 
                           x <- summary(x)
                           p.value<-signif(x$wald["pvalue"], digits=2)
                           wald.test<-signif(x$wald["test"], digits=2)
                           beta<-signif(x$coef[1], digits=2);#coeficient beta
                           HR <-signif(x$coef[2], digits=2);#exp(beta)
                           HR.confint.lower <- signif(x$conf.int[,"lower .95"], 2)
                           HR.confint.upper <- signif(x$conf.int[,"upper .95"],2)
                           HR <- paste0(HR, " (", 
                                        HR.confint.lower, "-", HR.confint.upper, ")")
                           res<-c(beta, HR, wald.test, p.value)
                           names(res)<-c("beta", "HR (95% CI for HR)", "wald.test", 
                                         "p.value")
                           return(res)
                           #return(exp(cbind(coef(x),confint(x))))
                       })
res <- t(as.data.frame(univ_results, check.names = FALSE))
as.data.frame(res)

但是,我在运行它时得到了它:

Error in (function (..., row.names = NULL, check.rows = FALSE, check.names = TRUE,  : 
  arguments imply differing number of rows: 5, 4
> as.data.frame(res)
Error in as.data.frame(res) : object 'res' not found

我不确定该如何解决。我看不到行的不同之处,也无法理解R为什么没有找到res。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

对象res是否出现在前面的代码中?您还可以检查它们是否在表中为空白。我不知道这是否对您有帮助。

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