Question

正如标题所述，我正在尝试编织RMarkdown文件，但收到错误消息：

Error in contrib.url(repos, "source) l trying to use CRAN without setting a mirror Calls: 
<Anonymous>... withvisible -> eval -> eval -> install.packages -> contrib.url Execution halted

在我的rmd文件的第20行上列出了我的install.packages时调用了错误。

install.packages("ggplot2")
install.packages("zoo")

library(ggplot2)
library(zoo)
library(gridExtra)

我不太确定这是什么，我尝试取出该程序包块看是否仍然会读取错误，但是很明显，当我在脚本中使用其中一个程序包时，它出错了。

任何建议将不胜感激，谢谢。

Answer 1

一个人可以使用installed.packages()函数来确定在执行Rmd脚本期间是否需要安装软件包。

例如，我们将检查是否安装了zoo软件包，并在必要时使用美国国家计算科学学会CRAN镜像进行安装（如OP注释中的r2evans所述）。

installedPackages <- installed.packages()[,1] 
if(!("zoo" %in% installedPackages)) install.packages("zoo",repos="https://mirrors.nics.utk.edu/cran/")
library(zoo)

将RMarkdown编织到工作文档中时出错，可能是由于安装了软件包

1 个答案: