在生物学图像上实现类似UNet的网络进行实例分割

时间:2020-05-02 16:22:00

标签: tensorflow computer-vision conv-neural-network image-segmentation unity3d-unet

我正在尝试针对基于UNet架构的生物图像进行实例分割的论文。到目前为止,我只编译了CNN,但仅用于检测的部分。我不知道如何在第一步中预测边界框,以及如何创建具有5种不同输出的混合网络。我必须编译并训练5个模型以获得理想的输出?这是我的普遍关注。 Two-headed U-Net 2体系结构:两次扩展 路径共享一条收缩路径中的特征图(FM)

论文具体写明:

“我们将对象Ok:=(mk,ck,bk,pk,yk)表示为元组, 其中mk:Ω→{0,1}是其二进制掩码,表示为二进制 图像域的函数Ω⊂N2,ck∈R2是其边界框中心,bk =(wk,hk)∈R2是边界框 宽度和高度,pk∈R2是用户定义的对象参考 靠近ck和yk∈{1,...,C}的点是其类 标签。我们将所有对象的集合表示为O = {O1,...,OK}。 字母上方的帽子表示预测变量,带撇号的变量表示3D表示。 x =(x,y)∈Ω是2D 图像坐标和x =(x,z)∈Ω×Z是3D空间中的对应坐标。”

那么,如何在具有核图像的数据集中处理这个问题呢?我不知道我能检测到谁的核中心,以及我可以将什么存储到二进制掩码中。我有遮罩图像,但是有很多物体(核)

有人可以帮助我解决这些问题吗?

这是论文的链接:ISOODL

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