根据R?中2个栅格之间的土地覆盖类型计算R2值。

时间:2020-03-21 15:55:38

标签: r raster scatter-plot tiff r-raster

我在r中有三个栅格

> lpjre
class      : RasterLayer 
dimensions : 2803, 5303, 14864309  (nrow, ncol, ncell)
resolution : 0.008333333, 0.008333333  (x, y)
extent     : 60.85, 105.0417, 15.95833, 39.31667  (xmin, xmax, ymin, ymax)
crs        : +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
source     : memory
names      : xxx 
values     : 0, 21  (min, max)

> gcre
class      : RasterLayer 
dimensions : 2803, 5303, 14864309  (nrow, ncol, ncell)
resolution : 0.008333333, 0.008333333  (x, y)
extent     : 60.85, 105.0417, 15.95833, 39.31667  (xmin, xmax, ymin, ymax)
crs        : +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
source     : memory
names      : layer 
values     : 0, 39.72  (min, max)

和一个土地覆盖物栅格

> tif4
class      : RasterLayer 
dimensions : 2803, 5303, 14864309  (nrow, ncol, ncell)
resolution : 0.008333333, 0.008333333  (x, y)
extent     : 60.85, 105.0417, 15.95833, 39.31667  (xmin, xmax, ymin, ymax)
crs        : +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
source     : C:/Users/XXXX/landusemaskedme.tif 
names      : landusemaskedme 
values     : 1, 12  (min, max)
attributes :
       ID                          zn
 from:  1 evergreen needleleaf forest
  to : 12                   croplands

我根据不同的土地覆盖类别在lpjregcre之间绘制散点图

plot(lpjre[tif4==2],gcre[tif4==2]) 

我想找到如何根据土地覆盖类型计算lpjregcre之间的r2值?

我尝试此代码并给出错误:

> cor(values(lpjre)[tif4==1], values(gcre)[tif4==1], use="complete.obs", method = 'pearson')
Error in values(gcre)[tif4 == 1] : invalid subscript type 'S4'

可复制的栅格:

library(raster)
ras1 <- raster(matrix(c(1,1,1,2,2,2)))
ras2 <- raster(matrix(c(1,1,1,2,2,2)))

#Generating landcover example data
raster2 <- raster(matrix(c(1,1,1,2,2,2,3,3,3),ncol =3))
raster2 <- as.factor(raster2)

rat <- levels(raster2 )[[1]]
rat[["landcover"]] <- c("land","ocean/lake", "rivers")
levels(raster2 ) <- rat

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您可以使用矢量转换。首先是一个可重现的示例:

library(raster)
set.seed(42)

ras1 <- raster(nrow = 10, ncol = 10)
ras2 <- raster(nrow = 10, ncol = 10)
lcc <- raster(nrow = 10, ncol = 10)
ras1[] <- runif(100)
ras2[] <- runif(100)
lcc[] <- sample(c(1,2), 100, replace = TRUE)

现在,您可以使用[]将栅格值转换为矢量。从那里开始,即使在栅格之间具有相应的几何特征,您也可以使用逻辑选择。

cor(ras1[lcc[] == 2], ras2[lcc[] == 2], use = "complete.obs", method = "pearson")
# [1] -0.1644459