如何从服务器上的bash脚本在虚拟环境中执行脚本?

时间:2020-03-10 09:52:23

标签: python anaconda pytorch virtualenv

我正在尝试使用oarsub在服务器的虚拟环境中运行python脚本:

所以首先我在服务器名称“ a”中运行此命令:

oarsub -l /host=1/gpu=1,walltime=2:00:00 './training_corpus1.sh'

training_corpus1.sh看起来像这样:

#!/bin/bash

cd /home/ge/ke/anaconda3/envs

source activate env

cd ~/eXP/bert

CUDA_VISIBLE_DEVICES=0,1 python training.py \
    --exp_name bert \ ...

在开始时,我想打开我的虚拟环境,然后运行脚本,但是我总是在OAR.18651.stderr文件中收到此错误:


./training_corpus1.sh: line 5: activate: No such file or directory
Traceback (most recent call last):
  File "training.py", line 18, in <module>
    from xlm.slurm import init_signal_handler, init_distributed_mode
  File "/home/ge/ke/eXP/bert/xlm/slurm.py", line 11, in <module>
    import torch
ImportError: No module named torch


火炬位于我的虚拟环境中,似乎没有打开。当使用“ conda”作为“源”的地方时,我得到:

./training_corpus1.sh: line 5: conda: command not found

1 个答案:

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对于虚拟环境,bash的激活命令为

source env/bin/activate

其中 env 是要激活的虚拟环境的目录。

PS。让我建议您以set -e开始任何脚本,以允许出现任何错误时快速失败:

#!/usr/bin/env bash
set -e
…