我正在尝试在python中运行this GitHub project，但是我只能使用Pycharm IDE的终端运行它。
根据GitHub存储库中的指南，我从$的开头删除了$ python train.py RGCN PPI符号，并可以在那里运行它。 $在这里是什么意思，如何在Python控制台中运行这样的文件（例如，在>>>符号之后）？
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'$'不是Python语法的一部分，它是表示命令提示符的文档中的直观提示。
要回答本文标题的问题，我将提供一些信息 首先说明如何将脚本加载到Python控制台。 但是，对于您的特定情况，则不需要此。向下滚动到 有关PyCharm中调试的部分。
有两种方法可以将脚本放入控制台。一种是简单地使用我在下面给出的两行代码的正确版本来加载它，或者可以将它作为模块加载-即使它原本不是一个模块。
通常，要在Python 2上的Python Shell中执行脚本，您可以
>>> execfile(r"<path to script here>")
在Python 3上，它更冗长：
>>> exec(open(r"<path to script here>").read())
其效果就像您将脚本剪切-n-粘贴到控制台中一样。控制台的全局作用域将获取文件中最左缩进的所有函数，类和变量。另外，它可能不会运行您的if __name__ == '__main__':块。但是你可以破解。
如果要将vars / classes / etc放置在控制台全局范围之外的其他范围内，则上述命令还有两个附加参数。第一个是globals的字典，另一个是locals的字典。您只需提供globals参数就可以摆脱困境-它只是您所需的普通字典对象。
如果要加载的文件是模块，则可以通过将其主文件夹附加到Python模块搜索路径，并使用import指令，将其导入，就像导入其他模块一样。即使不打算将其作为模块，也可以通过这种方式加载脚本。
>>> import sys
>>> sys.path.append(r'/Users/todd/projects/mymodule_folder')
>>> import mymodule
如果您对其进行了修改并想要重新加载它：
>>> import importlib
>>> importlib.reload(mymodule)
将脚本作为模块加载可以避免污染控制台的全局范围。加载后，只需在脚本函数和变量的名称前加上模块名称即可。模块名称将是不带扩展名.py的文件的名称。
如果脚本需要命令行选项，则可以将这些值硬编码到脚本中，并禁用尝试从CLI获取值的代码行。如果变得复杂，请考虑按照下一节中的说明在IDE中运行。
因此，以上就是您可以在所需的任何Python REPL控制台中运行python脚本的方法。
但是根本无法将脚本加载到Python控制台中 为您的目的所必需。您想调试一些脚本（train.py， test.py）来自此项目： https://github.com/microsoft/tf-gnn-samples）。
在许多情况下，编写Python脚本是从OS Shell运行并从用户那里获取命令行选项。可以将这些类型的脚本加载到Python控制台中，但是大多数脚本都需要一些小的技巧才能运行。但是，如果您只想调试这样的脚本，则无需弄乱控制台。
PyCharm支持像其他脚本一样按原样运行它们（Eclipse和其他IDE也是如此）。只需为项目创建运行/调试配置即可。我刚刚安装了PyCharm，并尝试了一下以记录详细信息。简单的任务。
只需在PyCharm中打开项目，然后在工具栏上的编辑器窗格上方，就有一个 Edit Configurations 的菜单选项。单击该按钮以打开运行/调试配置对话框，然后单击+添加配置。将出现一个带有预定义模板的小对话框-选择Python作为模板并接受。
然后在主对话框中，在脚本路径：中输入 train.py 的路径（或其他脚本），然后单击复选框 [ x]在输出控制台中仿真终端。 此外，您可以在 Parameters：文本框中添加命令行选项（我在文本中输入mymodel mytask只是为了满足脚本对两个参数的需求） 。单击底部的确定接受配置并关闭对话框。
现在，您应该在工具栏上看到一个绿色的bug图标。在脚本的__main__块中设置一个断点，然后单击debug图标开始调试脚本。那应该做！
PDB-Python调试器可以在没有IDE的情况下运行。这是调试各种脚本的另一种方法。如果需要命令行参数，请在启动调试器时从OS Shell提供它们：
$ pdb myscript.py mymodel mytask
这实际上就是启动调试会话的全部。 PDB需要一些基于文本的命令的知识。开始会话后，您可以输入l来获得当前执行行附近的代码清单。输入help以查看命令列表。
要单步执行，请输入“ s”作为步，或输入“ step”。要设置断点，请输入break <line-number>，或在表达式上设置断点。有关可用命令的参考，请参见：https://docs.python.org/2/library/pdb.html。在线也有很多版本的pdb速查表-仅在Google的“ pdb速查表”中选择一个即可。