我正在使用具有130 GB RAM的CentOS 7 Linux计算集群。我正在尝试使用e1071 R软件包中的SVM功能。我的矩阵尺寸是行= 350,列= 54250。
R脚本代码(file_testR.R)
matris=matrix(rnorm(100),350,54251)
matris <- as.data.frame(matris)
matris$new_variable <- 0
matris$new_variable[1:175] <- "yes"
matris$new_variable[176:350] <- "no"
require(e1071)
svmfit_test <- svm(as.factor(matris$new_variable)~., data = matris, kernel = "linear", cross=10)
现金代码
Rscript --max-ppsize=500000 file_testR.R
我收到以下错误消息:
Error in model.matrix.default(Terms, m) :
long vectors not supported yet: ../../src/include/Rinlinedfuns.h:522
Calls: svm ... svm.formula -> model.matrix -> model.matrix.default
如果有人可以帮助我理解此问题,我将不胜感激。