创建密度栅格并通过面要素提取和

时间:2020-01-22 15:06:29

标签: r spatial raster sf

我有一个多边形(zones)和一组坐标(points)。我想为整个多边形创建一个空间内核密度栅格,并按区域提取密度总和。多边形外的点应丢弃。

library(raster)
library(tidyverse)
library(sf)
library(spatstat)
library(maptools)

load(url("https://www.dropbox.com/s/iv1s5butsx2v01r/example.RData?dl=1"))
# alternatively, links to gists for each object
# https://gist.github.com/ericpgreen/d80665d22dfa1c05607e75b8d2163b84
# https://gist.github.com/ericpgreen/7f4d3cee3eb5efed5486f7f713306e96

ggplot() +
  geom_sf(data = zones) +
  geom_sf(data = points) +
  theme_minimal()

enter image description here

我尝试使用{ppp转换为spatstat,然后使用density(),但是结果中的单位让我感到困惑。我相信问题与地图的单位有关,但我不确定如何进行。

更新

以下是用于重现我创建的密度图的代码:

zones_owin <- as.owin(as_Spatial(zones))
pts <- st_coordinates(points)
p <- ppp(pts[,1], pts[,2], window=zones_owin, unitname=c("metre","metres"))
ds <- density(p) 
r <- raster(ds)
plot(r)

enter image description here

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我不确定这是否能回答您的所有问题,但应该是一个好的开始。如果您需要其他类型的输出,请在评论或问题中进行澄清。

它将删除不在“区域”多边形之一内的所有点,按区域对它们进行计数,并绘制由落入该点内的点数着色的区域。

library(raster)
library(tidyverse)
library(sf)
#> Linking to GEOS 3.6.2, GDAL 2.2.3, PROJ 4.9.3
library(spatstat)

library(maptools)
#> Checking rgeos availability: TRUE

load(url("https://www.dropbox.com/s/iv1s5butsx2v01r/example.RData?dl=1"))
# alternatively, links to gists for each object
# https://gist.github.com/ericpgreen/d80665d22dfa1c05607e75b8d2163b84
# https://gist.github.com/ericpgreen/7f4d3cee3eb5efed5486f7f713306e96

p1 <- ggplot() +
  geom_sf(data = zones) +
  geom_sf(data = points) +
  theme_minimal()

#Remove points outside of zones
points_inside <- st_intersection(points, zones)
#> although coordinates are longitude/latitude, st_intersection assumes that they are planar
#> Warning: attribute variables are assumed to be spatially constant throughout all
#> geometries
nrow(points)
#> [1] 308
nrow(points_inside)
#> [1] 201

p2 <- ggplot() + 
  geom_sf(data = zones) + 
  geom_sf(data = points_inside)

points_per_zone <- st_join(zones, points_inside) %>%
  count(LocationID.x)
#> although coordinates are longitude/latitude, st_intersects assumes that they are planar

p3 <- ggplot() + 
  geom_sf(data = points_per_zone, 
          aes(fill = n)) + 
  scale_fill_viridis_c(option = 'C')

points_per_zone
#> Simple feature collection with 4 features and 2 fields
#> geometry type:  POLYGON
#> dimension:      XY
#> bbox:           xmin: 34.0401 ymin: -1.076718 xmax: 34.17818 ymax: -0.9755066
#> epsg (SRID):    4326
#> proj4string:    +proj=longlat +ellps=WGS84 +no_defs
#> # A tibble: 4 x 3
#>   LocationID.x     n                                                    geometry
#> *        <dbl> <int>                                               <POLYGON [°]>
#> 1           10   129 ((34.08018 -0.9755066, 34.0803 -0.9757393, 34.08046 -0.975…
#> 2           20    19 ((34.05622 -0.9959458, 34.05642 -0.9960835, 34.05665 -0.99…
#> 3           30    29 ((34.12994 -1.026372, 34.12994 -1.026512, 34.12988 -1.0266…
#> 4           40    24 ((34.11962 -1.001829, 34.11956 -1.002018, 34.11966 -1.0020…

cowplot::plot_grid(p1, p2, p3, nrow = 2, ncol = 2)

看来我低估了您的问题的难度。您在寻找下面的图(及底层数据)吗?

enter image description here

它使用的栅格为〜50x50,栅格:: focal的窗口为9x9,均值用于插值数据。

答案 1 :(得分:1)

直接使用地理坐标(lon,lat)时,单位很难。如果可能,应转换为平面坐标(这是spatstat的要求),然后从那里开始。平面坐标通常以米为单位,但是我想这取决于特定的投影和下面的椭球等。您可以看到this answer,了解如何使用sf投影到平面坐标并导出到{使用spatstat的{​​1}}格式。 注意:您必须手动选择一个明智的投影(可以使用http://epsg.io找到一个投影),并且必须同时投影多边形和点。

一旦所有内容均为maptools格式,则可以使用spatstat进行内核平滑。所得的栅格值(类别density.ppp的对象)是点的强度,即每平方单位(例如平方米)的点数。如果要在某个区域上进行汇总,可以使用im获取具有给定强度的点过程模型在该区域中的预期点数。