尝试在R中进行网络绘图 如何使用IGraph延长网络图中的边缘?
我实际上想要使用fruchterman-reingold布局。有没有什么方法可以使基于力的算法“更加弹性”,以便我的顶点更远?
感谢。
答案 0 :(得分:16)
您可以使用layout.fruchterman.reingold
功能控制Fruchterman-Reingold算法。见:help('layout.fruchterman.reingold')
。我经常使用的设置让你有更多的间距:
l <- layout.fruchterman.reingold(g,niter=500,area=vcount(g)^2.3,repulserad=vcount(g)^2.8)
plot(g,layout=l)
其中g
是您的图表对象。最好只为图表测试这些参数的不同值,看看哪些有效。特别是repulserad
会影响图表中的间距。默认值是节点数的平方,因此较高的值应该可以获得更多的间隔图。
答案 1 :(得分:7)
如果layout.fruchterman.reingold
算法仍未通过调整参数给出您想要的内容,只需执行以下操作即可。每个布局都返回一组坐标,x和y坐标分别位于第一列和第二列。您可以在此处应用您喜欢的任何转换,如果您只想缩放它,只需使用
L = layout.fruchterman.reingold(G)*s; #Scaling factor s
当然也可以进行更多花哨的转换。仅供记录,您还可以使用鼠标手动编辑布局tkplot(G, layout=L)
。您可以通过L = tkplot.getcoords(1)
返回坐标。