如何在Ubuntu中升级IRKernel？

Question

在Ubuntu 18.04 LTS上，在JupyterNotebook（没有Anaconda）中运行R时，IRKernel正在读取R版本3.4。为了使用像cowplot这样的软件包，必须至少具有3.5版。

Answer 1

基本上，应采取两个步骤：

1. 更新R 。 These和that的答案是一个准则。
2. 更新IRKernel 。用于Linux的官方IRKernel instructions很有用。

接下来，描述完整的过程

1。将密钥添加到服务器

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9

2。将条目添加到sources.list

echo 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/' | sudo tee -a /etc/apt/sources.list

根据所使用的linux，您应该进行更改，例如，通过xenial或cosmic仿生，请查看https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/README.html

3。更新程序

根据上述链接中的说明，我们应该执行以下操作：

sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base
sudo apt-get install r-base-dev

4。更新/.local/share/jupyter/kernels/ir

在控制台中键入R，然后根据此link

进行后续步骤

# In the console
R
# Inside R
install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'IRkernel'), type = 'source')
getRversion() # to verify the new R version
IRKernel::installspec()

这应该显示以下消息：

[InstallKernelSpec] Removing existing kernelspec in /home/user_name/.local/share/jupyter/kernels/ir
[InstallKernelSpec] Installed kernelspec ir in /home/user_name/.local/share/jupyter/kernels/ir

最后，您应该删除R的较旧版本，您可以在〜/ R / x86_64-pc-linux-gnu-library中找到该版本，现在您将拥有两个目录，其中包含两个不同的版本或R（删除较旧的）。