为什么该代码段无法在Google Colab上运行?

时间:2019-12-19 16:56:44

标签: python pandas machine-learning scikit-learn google-colaboratory

我使用提供35 GB RAM的TPU。在尝试运行此代码片段之前,我有20 GB的可用RAM。但是由于ram低(我说需要超过35 GB),我无法运行该代码段,我使用了6 GB数据集。为什么这段代码占据了这么多位置?我使用了垃圾收集器,并删除了之前使用的数据框。我该怎么做才能使该代码正常工作?

Gen RAM Free:26.4 GB |进程大小:156.4 MB GPU RAM免费:16280MB |已用:0MB |利用率0%|总计16280MB

seed = 7
test_size = 0.4
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, Y, test_size=test_size)
gc.collect()
model=KNeighborsClassifier(n_neighbors=6,algorithm='kd_tree',n_jobs=25)
model.fit(X_train, y_train)

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

Python中的数据科学工作流往往占用大量内存。例如,如果您的输入数据X, Y消耗了6GB,则该行

X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, Y, test_size=test_size)

将另外消耗6 GB(每个创建的子集不是原始数组的视图,而是具有新内存占用的新数组对象)。

可以在数据KNeighborsClassifier中进行其他复制(例如,该算法中的代码要求输入数组为连续的C序float64数组,如果您的数据不符合该条件,则将复制一个副本)。制造)。

通常,对于基于numpy的数据科学工作流来说,一个很好的经验法则是,除非您非常谨慎,否则您将需要大约4-5倍于正在处理的原始数据大小的内存。防止数据复制。