当变量靠近时如何消除变量(即小于200毫秒->删除行)

时间:2019-12-17 17:42:13

标签: r heartrate

今天第一篇文章。

目前,我正在从事研究,我必须分析心率数据。 现在,我已经完成了大部分代码,我发现我正在使用的算法(RHRV)利用心跳的出现以及相匹配的秒数。

我的简单txt文件以秒为单位,因此看起来像这样(1列,433行): 0.905 1.943 2.941 4.005 4.998 5.921

这些是心跳,第二次发生。

我现在的问题是:如何删除不可能发生的情况,例如: 2次事件/心跳的发生速度超过0.2秒(200毫秒)

是否有一种简单的方法或功能可以让我更改数据?

期待您的回答!

干杯

桑德

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

# create some random values
set.seed(3)
heartBeats <- sort(runif(10))

# which of them are reasonable?
keepThese <- heartBeats - lag(heartBeats) > 0.02
keepThese[is.na(keepThese)] <- TRUE # remove NAs

# and now subset the original vector
heartBeats[keepThese]

答案 1 :(得分:0)

我想不出一种矢量化的方法来做到这一点,但这可行。请注意,这对于长向量来说将是昂贵的,因为表达式y <- c(y, x[i])将继续重建向量y

x <- c(171.1156, 171.1345, 171.256, 171.309, 171.465, 171.4986, 171.986, 172.563)
m <- 1
y <- numeric(0)
y[m] <- x[1]
for (i in 2:NROW(x)) {
    if (y[m] + 0.2 < x[i]) {
        m <- m + 1
        y <- c(y, x[i])
    }
}
y
# output
[1] 171.1156 171.4650 171.9860 172.5630

我遍历x的元素,每次遇到与y中最新接受的值相距0.2以上的值时,我用{{ 1}}。