查询AWS S3存储桶然后进行连接

时间:2019-12-10 22:03:23

标签: amazon-s3 cat

我正在尝试查询s3存储桶,然后将找到的文件连接到stdout:

aws s3 cp s3://path/to/Data/ - | zcat *fastq.gz | gzip -c > merged.fq.gz

我收到以下错误消息:

  

zcat:无法统计:* fastq.gz(* fastq.gz.Z):没有此类文件或目录

我也尝试指定一个文件并得到相同的错误。

aws s3 cp s3://path/to/Data/1a.fastq.gz - | zcat *fastq.gz | gzip -c > 1a_merged.fq.gz

感谢您的帮助!

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