这是此问题的后续解答:data.table efficient recycling
这里的区别是每行的未来年份不一定相同。.
我经常在data.table中使用回收,例如当我需要对未来几年进行预测时。我每年都会重复我的原始数据。
这可能会导致类似的结果:
library(data.table)
dt <- data.table(1:500000, 500000:1, rpois(500000, 240))
dt2 <- dt[, c(.SD, .(year = 1:V3)), by = 1:nrow(dt) ]
但是我经常不得不处理数百万行,并且比这个玩具示例中的列要多得多。时间增加了..试试这个:
library(data.table)
dt <- data.table(1:5000000, 5000000:1, rpois(5000000, 240))
dt2 <- dt[, c(.SD, .(year = 1:V3)), by = 1:nrow(dt) ]
我的问题是:有没有更有效的方法来实现这一目的?
感谢您的帮助!
答案 0 :(得分:4)
这是其他答案的略有改进的版本。
unlist
rep.int
而不是rep
seq_len
而不是:
setDT
而非data.table()
sequence
函数甚至更好vecseq
的进一步细微改进似乎总会有所作为。
时间...
library(data.table)
f0 = function(dt) {
dt[, c(.SD, .(year = 1:V3)), by = 1:nrow(dt) ]
}
f1 = function(dt) {
dt2 <- data.table(
rep(dt$V1, dt$V3),
rep(dt$V2, dt$V3),
rep(dt$V3, dt$V3),
unlist(lapply(dt$V3, function(x){1:x}))
)
dt2
}
f2 = function(dt) {
dt2 = list(
V1 = rep.int(dt$V1, dt$V3),
V2 = rep.int(dt$V2, dt$V3),
V3 = rep.int(dt$V3, dt$V3),
year = unlist(lapply(dt$V3, seq_len), recursive=FALSE, use.names=FALSE)
)
setDT(dt2)
dt2
}
f3 = function(dt) {
## even better with sequence function suggested by @Cole
dt2 = list(
V1 = rep.int(dt$V1, dt$V3),
V2 = rep.int(dt$V2, dt$V3),
V3 = rep.int(dt$V3, dt$V3),
year = sequence(dt$V3)
)
setDT(dt2)
dt2
}
f4 = function(dt) {
dt[, c(lapply(.SD, rep.int, V3), year = .(sequence(V3)))]
}
f5 = function(dt) {
dt2 = list(
V1 = rep.int(dt$V1, dt$V3),
V2 = rep.int(dt$V2, dt$V3),
V3 = rep.int(dt$V3, dt$V3),
year = data.table:::vecseq(rep.int(1L,length(dt$V3)), dt$V3, NULL)
)
setDT(dt2)
dt2
}
基于“大”数据
dt <- data.table(1:5000000, 5000000:1, rpois(5000000, 240))
system.time(f0(dt))
# user system elapsed
# 22.100 18.914 40.449
system.time(f1(dt))
# user system elapsed
# 35.866 15.607 51.475
system.time(f2(dt))
# user system elapsed
# 22.922 6.839 29.760
system.time(f3(dt))
# user system elapsed
# 6.509 6.723 13.233
system.time(f4(dt))
# user system elapsed
# 12.140 14.114 26.254
system.time(f5(dt))
# user system elapsed
# 6.448 4.057 10.506
无论如何,您应该尝试改善在扩展数据集上运行的流程,因为也许您不必首先进行扩展。
例如,在frollmean
函数中,有一个参数adaptive
使得可以在可变长度窗口上计算滚动平均值,通常在该窗口中计算该变量首先需要扩展数据。
数据中的V3
大大提醒了自适应移动平均值的窗口长度。
答案 1 :(得分:0)
这是一种更快的实现方式,但是由于lapply
中的data.table
循环而仍然很长
dt2 <- data.table(
rep(dt$V1, dt$V3),
rep(dt$V2, dt$V3),
rep(dt$V3, dt$V3),
unlist(lapply(dt$V3, function(x){1:x}))
)
我希望这对您有帮助!
答案 2 :(得分:0)
尝试一下:
dt2 <- dt[dt[,rep(1:nrow(dt),V3)],]
dt2[,year:= dt[,sequence(V3)]]