尝试将颜色信息与子组链接时出现“无效的因子水平，NA生成”错误

Question

我正在尝试通过此操作将我的数据框链接到颜色。但是，我继续收到

  

“警告消息：   在[<-.factor（*tmp*中，pca_matrix [，“ Subgroup”] == 1，值= c（1L，：     无效的因子水平，生成了NA”

samples_names <- row.names(PCA_Model$rotation)
# Bind sample names to their subgroup
pca_matrix <- cbind(samples_names, "Subgroup"=labeled_subgroup, stringsAsFactors=FALSE)
# Link dataframe to color
pca_matrix[,"Subgroup"][pca_matrix[,"Subgroup"]==1] <- "blue"
pca_matrix[,"Subgroup"][pca_matrix[,"Subgroup"]==2] <- "red"
pca_matrix[,"Subgroup"][pca_matrix[,"Subgroup"]==3] <- "yellow"
pca_matrix[,"Subgroup"][pca_matrix[,"Subgroup"]==4] <- "green"
pca_matrix[,"Subgroup"][pca_matrix[,"Subgroup"]==5] <- "black"
pca_matrix[,"Subgroup"][pca_matrix[,"Subgroup"]==6] <- "white"

我在网上阅读了其他问题，这是因为我的字符变量正在成为一个因素，在使数据框强制stringsAsFactors = FALSE成为字符时，我应该使用"Type"标志。

我的数据框如下所示，并包含子组C1-C6。我想将子组链接到一种颜色，以便可以将数据绘制为3d图，并使用颜色信息来区分组。

Answer 1

不是一个一个地做，而是一个factor

factor(pca_matrix[,"Subgroup"], levels = paste0("C", 1:6), 
      labels = c("blue", "red", "yellow", "green", "black", "white"))