我的R出现内存问题。 我正在对我的机构中通过集群安装在家里的anaconda安装的R进行大型而复杂的分析。我创建了环境,以便可以毫无问题地安装软件包。运行时发生以下错误:
Error: cannot allocate vector of size 26.7 Gb
我通过键入memory.limit()检查了内存限制,但它似乎是Inf。
这是我的sessionInfo()的输出
R version 3.6.1 (2019-07-05) Platform: x86_64-conda_cos6-linux-gnu (64-bit) Running under: CentOS Linux 7 (Core) Matrix products: default BLAS/LAPACK: /home/user/miniconda3/envs/py37/lib/libopenblasp-r0.3.7.so locale: [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C [3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C [9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C attached base packages: [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base loaded via a namespace (and not attached): [1] compiler_3.6.1 tools_3.6.1
在运行负责该问题的工具时,我对具有24个内核的单个节点执行了ssh,以允许管道运行。 谁能帮我解决这个问题?预先谢谢你!