我试图通过从另一个NetCDf文件(“源”文件)中获取值来填充NetCDF文件中的nan值(我们称之为“目标”文件)。 [这两个示例文件可以下载from here] ,我当时正在考虑使用以下框架在python中进行此操作:
Step1-识别目标文件中的nan值,然后提取 位置(经度/纬度),存储在数据框中
Step2-从中提取存储的经/纬度的相应值 源文件
Step3-将这些值写入目标文件
我想到了以下代码:
import pandas as pd
import xarray as xr
import numpy as np
Source = xr.open_dataset("Source.nc")
Target = xr.open_dataset("Target.nc")
#Step 1
df = Target.to_dataframe()
df=df.reset_index()
df2=(df.loc[df['ET'].isin([32767,'nan'])])
#Step2
lat = df2["lat"]
lon = df2["lon"]
point_list = zip(lat,lon)
Newdf = pd.DataFrame([])
for i, j in point_list:
dsloc = Source.sel(lat=i,lon=j,method='nearest')
DT=dsloc.to_dataframe()
Newdf=Newdf.append(DT,sort=True)
存在三个问题: 1-我不知道该怎么做第三步
2-第二步需要花很长时间才能完成,因为可能还有很多遗漏点
3-这只是一步!使用这两个文件。
因此,我相信在python或cdo / Nco中可能会有更好的方法,更容易,更快地执行此操作… 欢迎任何想法和解决方案……谢谢…… 请注意,两个NC文件的空间分辨率(尺寸)不同。
答案 0 :(得分:2)
您可以使用Xarray's where
method。如果您完全关心效率,那么您真的想远离python for循环。这是一个如何工作的示例:
# these are the points you want to keep
# you can fine tune this further (exclude values over a threshold)
condition = target.notnull()
# fill the values where condition is false
target_filled = target.where(condition, source)