嘿,
我有一个带家庭三重奏的data.frame,我想添加一列,其中包含每个“ id”(=后代)的完整同胞。
我的数据:
df
id dam sire
1: 83295 67606 79199
2: 83297 67606 79199
3: 89826 67606 79199
我要检索的内容:
df2
id dam sire fs1 fs2
1: 83295 67606 79199 83297 89826
2: 83297 67606 79199 83295 89826
3: 89826 67606 79199 83295 83297
我尝试过的事情:
(类似于:How to transform a dataframes row into columns in R?)
library(dplyr)
library(splitstackshape)
df2 <- df %>%
group_by(dam,sire) %>%
summarise(id = toString(id)) %>%
cSplit("id") %>%
setNames(paste0("fs_", 1:ncol(.)))
colnames(df2) <- c("dam", "sire", "id", "fs1", "fs2")
每个父母二人组只给我一行(而不是每个“ id”都创建同一行):
df2
dam sire id fs1 fs2
1: 67606 79199 83295 83297 89826
在某些情况下,没有完整的同胞,在某些情况下,将有15个同胞。
在此先感谢您的建议! :)
答案 0 :(得分:1)
我们可以group_by
dam
和sire
使用id's
获得除当前id
以外的所有setdiff
,然后使用cSplit
将逗号分隔的值分成不同的列。
library(splitstackshape)
library(dplyr)
df %>%
group_by(dam, sire) %>%
mutate(fs = purrr::map_chr(id, ~toString(setdiff(id, .x)))) %>%
cSplit("fs")
# id dam sire fs_1 fs_2
#1: 83295 67606 79199 83297 89826
#2: 83297 67606 79199 83295 89826
#3: 89826 67606 79199 83295 83297
数据
df <- structure(list(id = c(83295L, 83297L, 89826L), dam = c(67606L,
67606L, 67606L), sire = c(79199L, 79199L, 79199L)), class = "data.frame",
row.names = c("1:", "2:", "3:"))