我目前正在尝试使用PyTorch的DataLoader处理数据以将其输入到深度学习模型中,但遇到了一些困难。
我需要的数据为(minibatch_size=32, rows=100, columns=41)
。我在编写的自定义__getitem__
类中拥有的Dataset
外套看起来像这样:
def __getitem__(self, idx):
x = np.array(self.train.iloc[idx:100, :])
return x
之所以这样写,是因为我希望DataLoader一次处理形状为(100, 41)
的输入实例,而我们有32个这样的单个实例。
但是,我注意到与最初的想法相反,DataLoader传递给函数的idx
参数不是顺序的(这很关键,因为我的数据是时间序列数据)。例如,打印值给我这样的东西:
idx = 206000
idx = 113814
idx = 80597
idx = 3836
idx = 156187
idx = 54990
idx = 8694
idx = 190555
idx = 84418
idx = 161773
idx = 177725
idx = 178351
idx = 89217
idx = 11048
idx = 135994
idx = 15067
这是正常行为吗?我发布此问题是因为要返回的数据批次不是我最初希望的数据批次。
在使用DataLoader之前,我用来预处理数据的原始逻辑是:
txt
或csv
文件中读取数据。(100, 41)
,而其中的32个形成一个小批量,我们通常以大约100个批次结束并相应地调整数据的形状。(32, 100, 41)
。我不确定我还应该如何处理DataLoader挂钩方法。任何提示或建议,我们将不胜感激。预先感谢。
答案 0 :(得分:2)
定义idx的是sampler
或batch_sampler
,如您所见here(开源项目是您的朋友)。在此code(和注释/文档字符串)中,您可以看到sampler
和batch_sampler
之间的区别。如果您查看here,将会看到如何选择索引:
def __next__(self):
index = self._next_index()
# and _next_index is implemented on the base class (_BaseDataLoaderIter)
def _next_index(self):
return next(self._sampler_iter)
# self._sampler_iter is defined in the __init__ like this:
self._sampler_iter = iter(self._index_sampler)
# and self._index_sampler is a property implemented like this (modified to one-liner for simplicity):
self._index_sampler = self.batch_sampler if self._auto_collation else self.sampler
请注意,这是_SingleProcessDataLoaderIter
的实现;您可以找到_MultiProcessingDataLoaderIter
here(使用的ofc取决于num_workers
的值,您可以看到here)。回到采样器,假设您的数据集不是_DatasetKind.Iterable
,并且您没有提供自定义采样器,则意味着您正在使用(dataloader.py#L212-L215):
if shuffle:
sampler = RandomSampler(dataset)
else:
sampler = SequentialSampler(dataset)
if batch_size is not None and batch_sampler is None:
# auto_collation without custom batch_sampler
batch_sampler = BatchSampler(sampler, batch_size, drop_last)
让我们看一下how the default BatchSampler builds a batch:
def __iter__(self):
batch = []
for idx in self.sampler:
batch.append(idx)
if len(batch) == self.batch_size:
yield batch
batch = []
if len(batch) > 0 and not self.drop_last:
yield batch
非常简单:它从采样器获取索引,直到达到所需的batch_size。
现在出现问题“ __getitem__的idx在PyTorch的DataLoader中如何工作?”可以通过查看每个默认采样器的工作方式来回答。
class SequentialSampler(Sampler):
def __init__(self, data_source):
self.data_source = data_source
def __iter__(self):
return iter(range(len(self.data_source)))
def __len__(self):
return len(self.data_source)
__iter__
的实现):def __iter__(self):
n = len(self.data_source)
if self.replacement:
return iter(torch.randint(high=n, size=(self.num_samples,), dtype=torch.int64).tolist())
return iter(torch.randperm(n).tolist())
因此,由于您未提供任何代码,我们只能假设:
shuffle=True
_DatasetKind.Iterable