__getitem__的idx在PyTorch的DataLoader中如何工作?

时间:2019-11-13 09:51:06

标签: python pytorch dataloader

我目前正在尝试使用PyTorch的DataLoader处理数据以将其输入到深度学习模型中,但遇到了一些困难。

我需要的数据为(minibatch_size=32, rows=100, columns=41)。我在编写的自定义__getitem__类中拥有的Dataset外套看起来像这样:

def __getitem__(self, idx):
    x = np.array(self.train.iloc[idx:100, :])
    return x

之所以这样写,是因为我希望DataLoader一次处理形状为(100, 41)的输入实例,而我们有32个这样的单个实例。

但是,我注意到与最初的想法相反,DataLoader传递给函数的idx参数不是顺序的(这很关键,因为我的数据是时间序列数据)。例如,打印值给我这样的东西:

idx = 206000
idx = 113814
idx = 80597
idx = 3836
idx = 156187
idx = 54990
idx = 8694
idx = 190555
idx = 84418
idx = 161773
idx = 177725
idx = 178351
idx = 89217
idx = 11048
idx = 135994
idx = 15067

这是正常行为吗?我发布此问题是因为要返回的数据批次不是我最初希望的数据批次。

在使用DataLoader之前,我用来预处理数据的原始逻辑是:

  1. txtcsv文件中读取数据。
  2. 计算数据中有多少批次,并相应地切片数据。例如,由于一个输入实例的形状为(100, 41),而其中的32个形成一个小批量,我们通常以大约100个批次结束并相应地调整数据的形状。
  3. 一个输入的形状为(32, 100, 41)

我不确定我还应该如何处理DataLoader挂钩方法。任何提示或建议,我们将不胜感激。预先感谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

定义idx的是samplerbatch_sampler,如您所见here(开源项目是您的朋友)。在此code(和注释/文档字符串)中,您可以看到samplerbatch_sampler之间的区别。如果您查看here,将会看到如何选择索引:

def __next__(self):
    index = self._next_index()

# and _next_index is implemented on the base class (_BaseDataLoaderIter)
def _next_index(self):
    return next(self._sampler_iter)

# self._sampler_iter is defined in the __init__ like this:
self._sampler_iter = iter(self._index_sampler)

# and self._index_sampler is a property implemented like this (modified to one-liner for simplicity):
self._index_sampler = self.batch_sampler if self._auto_collation else self.sampler

请注意,这是_SingleProcessDataLoaderIter的实现;您可以找到_MultiProcessingDataLoaderIter here(使用的ofc取决于num_workers的值,您可以看到here)。回到采样器,假设您的数据集不是_DatasetKind.Iterable,并且您没有提供自定义采样器,则意味着您正在使用(dataloader.py#L212-L215):

if shuffle:
    sampler = RandomSampler(dataset)
else:
    sampler = SequentialSampler(dataset)

if batch_size is not None and batch_sampler is None:
    # auto_collation without custom batch_sampler
    batch_sampler = BatchSampler(sampler, batch_size, drop_last)

让我们看一下how the default BatchSampler builds a batch

def __iter__(self):
    batch = []
    for idx in self.sampler:
        batch.append(idx)
        if len(batch) == self.batch_size:
            yield batch
            batch = []
    if len(batch) > 0 and not self.drop_last:
        yield batch

非常简单:它从采样器获取索引,直到达到所需的batch_size。

现在出现问题“ __getitem__的idx在PyTorch的DataLoader中如何工作?”可以通过查看每个默认采样器的工作方式来回答。

class SequentialSampler(Sampler):
    def __init__(self, data_source):
        self.data_source = data_source

    def __iter__(self):
        return iter(range(len(self.data_source)))

    def __len__(self):
        return len(self.data_source)
def __iter__(self):
    n = len(self.data_source)
    if self.replacement:
        return iter(torch.randint(high=n, size=(self.num_samples,), dtype=torch.int64).tolist())
    return iter(torch.randperm(n).tolist())

因此,由于您未提供任何代码,我们只能假设:

  1. 您在DataLoader
  2. 中使用shuffle=True
  3. 您正在使用自定义采样器
  4. 您的数据集为_DatasetKind.Iterable