无法使用SRA工具包中的fastq-dump，因为无法在@INC中找到XML / LibXML.pm

Question

我正在尝试使用SRA工具包https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=toolkit_doc&f=st中的fastq-dump函数 我遇到错误

  

    

在@INC中找不到XML / LibXML.pm（您可能需要安装XML :: LibXML模块）（@ INC包含：/Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/site_perl/5.26.2/darwin-多线程2级/Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/site_perl/5.26.2 /Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/5.26.2/darwin-thread-multi-2level /Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/5.26。 2。）在./fastq-dump第13行。     BEGIN失败-在./fastq-dump第13行中，编译中止。

  

我使用

安装了XML :: LibXML模块

  

    

cpan安装XML :: LibXML

  

但是，我不断遇到同样的错误。

有人可以帮忙吗？

Answer 1

我根据

的完整安装解决了SRA Toolkit 2.10的相同问题

https://github.com/ncbi/sra-tools/issues/219#issuecomment-524331336