用于可视化分层网络并评估从网络中删除节点的影响的工具

Question

使用NetworkX可视化系统之间的数据流。这很好用，但是可视化似乎有些乏味，此外，我想与网络进行交互，执行诸如删除节点或“检查”节点之类的操作。我还尝试了Power BI和Gephi之类的工具，但是它们都有问题。

有哪些BI工具/ Python库等可以有效地可视化有向网络图并与之交互？

Answer 1

您有两个问题应分别处理：可视化和交互性。

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可视化：

NetworkX有一些工具可以有效地可视化层次图。他们正在使用Graphviz库和pygraphviz/pydot接口。这是示例：

import networkx as nx

# Create the hierarchical graph (DAG)
G = nx.fast_gnp_random_graph(70, 0.02)
G.remove_edges_from([(x, y) for (x, y) in G.edges if x > y])
G = nx.subgraph(G, max(nx.connected_components(G), key=lambda x: len(x)))

# Draw it with default function
nx.draw(G, node_size=50)

# Draw it with graphviz_layout
nx.draw(G, node_size=50, pos=nx.nx_agraph.graphviz_layout(G, prog='dot'))

如果要使用Graphviz本身来可视化图形，可以convert it to DOT file，稍后再使用Graphviz的全部功能。

您还可以使用Bokeh或D3.js之类的Javascript库以更具交互性的方式绘制NetworkX图（您可以在这些库中以交互方式选择节点，突出显示边缘和其他内容）。 / p>

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互动性：

此问题比可视化问题复杂得多。 Python没有稳定，流行的库/程序，可以让您在交互式GUI中操作图形。交互需要非常复杂的软件，而Python却没有。

最适合您的软件是：

• Gephi（它没有层次结构图的默认可视化功能，但是您可以下载一个插件来执行此操作）。
• Cytoscape-也许比Gephi更适合您。
• Wolfram Mathematica-很好，但是要花钱。