R-`：=`中的错误（变量，as.character（variable））

Question

我正在尝试运行R脚本，可以使用以下命令在here中找到该脚本  plot_trace.R -m ./log.model.csv ./log.trace.csv。

可以找到两个here的csv文件。

这会产生错误：

Error in `:=`(variable, as.character(variable)) : 
  Check that is.data.table(DT) == TRUE. Otherwise, := and `:=`(...) are defined for use in j, once only and in particular ways. See help(":=").
Calls: [ -> [.tbl_df -> check_names_df -> :=

最后但并非最不重要的我的sessionInfo（）输出：

R version 3.4.4 (2018-03-15)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 18.04.3 LTS

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.7.1
LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.7.1

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.4.4

谢谢

Answer 1

更新

我发现此脚本有两个问题：

• 作者将tidyr中的函数与类data.table的变量混合在一起。这些函数可能会返回数据帧，并且在这些函数上使用data.table语法会导致错误。不幸的是，某些tidyr函数在进行操作时可能会返回data.table，但这似乎因tidyr软件包的版本而有很大差异。

• unnest中的tidyr函数具有新的界面。该脚本无法与tidyr 1.0.0或更高版本一起使用。

下面是我使用R版本3.6.1和tidyr版本1.0.0更改以修复脚本的行：

• 第56行：添加了trace.df <- as.data.table(trace.df)
• 第64行：更改为trace.df <- unnest(trace.df, cols)
• 第65行：添加了trace.df <- as.data.table(trace.df)

原始答案

我能够在您提供的数据上运行脚本而没有错误。两者

Rscript --vanilla plot_trace.R -m ./log.model.csv ./log.trace.csv

和

chmod +x plot_trace.R
./plot_trace.R -m ./log.model.csv ./log.trace.csv

产生了以下情节：

您可以在RStudio中逐步运行脚本来检查trace.df的类吗？

Answer 2

看起来unnest调用正在创建不是数据表的内容。

在第56行尝试添加：

trace.df <- as.data.table(trace.df)