Question

这是输入列表（在file_id.txt中）：

file-F0Y6GbQ09k704jfGBQX0pgF8
file-FfYqQv00ypGfqQKkF96zX3yV
file-FfYqPf80ypGj712qFBggV2BV
file-FfQpFYQ0ypGqfjkJ8z90Ygzv
file-FfQpFYQ0ypGpQ4K7GGj40VVZ
file-FfQpFYQ0ypGxV3xG7BZQxz3y
file-FfQpFYQ0ypGZ3ZVk7745ZGFf
file-Ff0Qk100ypGYV26V52JZkJ0q
file-FfK1pZ80ypGjgyF73b3fFjgG

这是所需的输出（output.json）：

{
 "stage-xxx.input_files": [
  {"$dnanexus_link": "file-F0Y6GbQ09k704jfGBQX0pgF8"},
  {"$dnanexus_link": "file-FfYqQv00ypGfqQKkF96zX3yV"},
  {"$dnanexus_link": "file-FfYqPf80ypGj712qFBggV2BV"},
  {"$dnanexus_link": "file-FfQpFYQ0ypGqfjkJ8z90Ygzv"},
  {"$dnanexus_link": "file-FfQpFYQ0ypGpQ4K7GGj40VVZ"},
  {"$dnanexus_link": "file-FfQpFYQ0ypGxV3xG7BZQxz3y"},
  {"$dnanexus_link": "file-FfQpFYQ0ypGZ3ZVk7745ZGFf"},
  {"$dnanexus_link": "file-Ff0Qk100ypGYV26V52JZkJ0q"},
  {"$dnanexus_link": "file-FfK1pZ80ypGjgyF73b3fFjgG"}
 ]
}

这是我当前的代码：

#!/usr/bin/python3 env
fname = input("Enter file name of the list: ")
if len(fname) < 1 : fname = "file_id.txt"

stage_name = input("Enter stage name for the input: ")
if len(stage_name) < 1 : stage_name = "stage-xxx"

input_var = input("Enter input variable name: ")
if len(input_var) < 1 : input_var = "input_files"

fh = open(fname)

out_file = open('output.json', 'w')
out_file.write('{\n "' + f'{stage_name}' + "." + f'{input_var}' + '": [' + "\n")
for line in fh:
    fileid = line.rstrip()
    out_file.write("  {" + "\"$dnanexus_link\": " + f'"{fileid}"' + "},\n")
out_file.write(' ]\n}\n')
out_file.close()
print("output.json created!")

我是python的新手，不确定在输出json中最后一个文件的末尾如何删除逗号。而且我想知道是否有一种方法可以使用json模块将文件列表转储为json格式，而无需使用静态文本编码。.

Answer 1

此代码读取list个文件中dict个的文件。

然后我将此list包装在最后的dict中，并使用json.dumps（）获得一个字符串：

import json

with open('file_id.txt') as f:
    txt = [{'$dnanexus_link': line.strip()} for line in f]

#print(txt)

d = {'stage-xxx.input_files': txt}
print(json.dumps(d))

输出为您的output.json，但仅输出一行。

寻找使用python3将文本列表转换为json字符串的更好方法

1 个答案: