在尝试创建工具毒蛇的新环境时,我在解决软件包规格时陷入困境。
我已经从他们的website下载了该工具,并将其解压缩。按照说明,我尝试创建一个名为viper的conda环境。
使用命令
conda env create -f environment.yml -n viper
该过程如上所述卡住了。 所以我尝试了
conda create --file environment.yml -n viper
但是我得到了错误
CondaValueError: could not parse 'name: viper' in: environment.yml
我的environment.yml文件的头文件附在下面
name: viper
channels: #!!python/tuple
- bioconda
- conda-forge
- defaults
dependencies:
- ...
我做错了什么?
我的conda版本是这样的:
$ conda info
Current conda install:
platform : linux-64
conda version : 4.3.30
conda is private : False
conda-env version : 4.3.30
conda-build version : not installed
python version : 3.6.3.final.0
requests version : 2.18.4
root environment : /home/yeroslaviz/miniconda3 (writable)
default environment : /home/yeroslaviz/miniconda3
envs directories : /home/yeroslaviz/miniconda3/envs
/home/yeroslaviz/.conda/envs
package cache : /home/yeroslaviz/miniconda3/pkgs
/home/yeroslaviz/.conda/pkgs
channel URLs : https://repo.continuum.io/pkgs/main/linux-64
https://repo.continuum.io/pkgs/main/noarch
https://repo.continuum.io/pkgs/free/linux-64
https://repo.continuum.io/pkgs/free/noarch
https://repo.continuum.io/pkgs/r/linux-64
https://repo.continuum.io/pkgs/r/noarch
https://repo.continuum.io/pkgs/pro/linux-64
https://repo.continuum.io/pkgs/pro/noarch
config file : None
netrc file : None
offline mode : False
user-agent : conda/4.3.30 requests/2.18.4 CPython/3.6.3 Linux/4.4.0-72-generic debian/stretch/sid glibc/2.23
UID:GID : 1000:1000
谢谢
答案 0 :(得分:5)
conda create --file environment.yml -n viper
不起作用。此命令尝试将environment.yml
中的每一行解析为一个包名。
您应该使用conda env create --file environment.yml -n viper
。
请耐心等待冲突解决。