如何使Conda和Virtualenv在Mac OS Catalina上工作？

Question

我以前曾让Conda在Mojave上顺利运行，但是我发现升级到Catalina会将“ anaconda3”文件夹移动到“桌面”>“重定位项”>“安全性”>“ anaconda3”。似乎Catalina的安全设置可能不再允许应用程序直接安装在用户目录下。

我尝试了建议here，写在下面：

  

嗨，我可能有解决办法

     

  
• 将位于“重定位项”中的文件夹anaconda3复制到/ Users / myname /
  
• 打开终端
  
• 输入：export PATH =“ / Users / myname / anaconda3 / bin：$ PATH”
  
• 输入：conda init zsh
  

     

成功了！祝好运！

但这对我不起作用。在conda init zsh之后，我得到：

  

-bash：/ Users / USER / anaconda3 / bin / conda：/ anaconda3 / bin / python：错误的解释器：没有这样的文件或目录

如何在不丢失所有虚拟环境的情况下重新启动并运行Conda？谢谢！

---

更新

我按照@Ted Shaowang的建议让Conda工作。这意味着conda env list显示了通过Conda创建的所有虚拟环境。

但是我仍然遇到virtualenv的问题，因为自从我更改了默认的anaconda3文件位置以来，找不到python。

找不到位于.virtualenvs/env/bin/python的python可执行文件。我是否还需要进行进一步的更改以使python也可以从virtualenv开始工作？

Answer 1

我有完全相同的问题，这对我有用：

将anaconda从“重新分配的项目”移至~/anaconda3后，将~/anaconda3/bin/conda文件的第一行从#!/anaconda3/bin/python移至#!/Users/USERNAME/anaconda3/bin/python以反映更改。

Answer 2

我可能会放弃使用上述解决方案。该~/anaconda3/bin目录具有许多可运行对象（而不仅仅是conda一个），需要以这种手动方式对其进行更改。例如，除非进行相同的更改，否则您将无法运行jupyter notebook，也不能从base或其他环境运行。

我的提示：尝试获取虚拟环境的需求文件，然后重新安装。您可以使用pipreqs来获取用于各个项目的需求：https://www.idiotinside.com/2015/05/10/python-auto-generate-requirements-txt/

Answer 3

不解决文件中固有的硬编码前缀条目，没有解决方案将完全起作用。 https://www.anaconda.com/how-to-restore-anaconda-after-macos-catalina-update/

中有更长的描述和建议的修复程序

Answer 4

从技术上讲，这是在重新安装anaconda，但是，我恢复了所有conda env，因此，希望这是可以接受的解决方案！

这是几分钟前我在Catalina上运行它的方式（现在使用z-shell）： -验证了我的桌面上是否存在“已重定位项目”目录以及内部的“ anaconda3”目录及其内容 -导航到“ anaconda3”下的envs目录，并使查找程序窗口保持打开状态（请参见屏幕截图）

之后：

• 打开新的终端（z-shell）

• 运行（已安装到/ usr / local / anaconda3）：

  酒桶安装蟒蛇

• 安装成功后，我打开了〜/ .zshrc文件（用于我的z-shell别名）并添加了以下行：

  export PATH =“ / usr / local / anaconda3 / bin：$ PATH”

• 保存了我的〜/ .zshrc文件，然后重新加载：

  源〜/ .zshrc

• 要验证conda命令现在可以正常运行，我跑了：

  conda环境列表

• 对我来说，这表明它是一个基本环境，就是这样

• 然后将Finder打开到新的环境位置： 打开/ usr / local / anaconda3 / envs/。

• 我将所有旧的env拖动（移动）到新的envs文件夹中，然后运行：

  conda环境列表

我所有的旧环境又回来了！ ：）

• 更新了我的PyCharm解释器/环境路径以反映这些环境的新位置（必须在之后重新启动PyCharm，但现在可以了！）
• 完成

Answer 5

这对我有用。

这些是我的头文件（Catalina 10.15）：

/Library/Developer/CommandLineTools/usr/include/c++/v1/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.14.sdk/usr/include/sys/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.14.sdk/usr/include/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.14.sdk/System/Library/Frameworks/Kernel.framework/Versions/A/Headers/sys/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.15.sdk/usr/include/sys/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.15.sdk/usr/include/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.15.sdk/System/Library/Frameworks/Kernel.framework/Versions/A/Headers/sys/stdio.h

运行sudo find /Library -name stdio.h来查看您的位置。

Mojave 10.14头文件：

$ sudo find /Library -name stdio.h 
/Library/Developer/CommandLineTools/usr/include/c++/v1/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk/usr/include/sys/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk/usr/include/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk/System/Library/Frameworks/Kernel.framework/Versions/A/Headers/sys/stdio.h

可以看出，与Mojave不同，SDK现在分为MACOSX10.14和10.15。

TLDR

所以，这些是我在Catalina上的SDK文件夹：

1. 将MacOSX.sdk重命名为MacOSX_orig.sdk
2. 右键单击MacOSX10.14.sdk
3. 重复
4. 将重复的文件夹重命名为MacOSX.sdk

您的文件夹结构现在应如下所示：

像这样，我们基本上将以前版本的OSX SDK作为sysroot使用。希望这会有所帮助。

Answer 6

不确定是否将其视为评论或至少是临时的答案，但是我现在暂时不要尝试解决Anaconda的任何Catalina兼容性问题。请参见此GitHub问题。

Answer 7

我遇到了同样的问题，对我来说这是可行的： 我的解决方案：

1. 从Relocated Items文件夹复制anaconda3
2. 粘贴用户名/您的用户名
3. 使用编辑器打开anaconda3 / bin中的conda文件，并将第一行#!/anaconda3/bin/python修改为#!/Users/YourUserName/anaconda3/bin/python
4. 保存并运行conda文件
5. 打开终端
6. 运行此命令：export PATH=''/Users/YourUserName/anaconda3/bin:$PATH"
7. 运行conda init zsh

Answer 8

我遇到了同样的问题，以下解决方案对我有效，这是最简单的解决方案：

与其将混乱的anaconda3文件从重新定位的项目复制到User / USERNAME目录中，不如将其从官方网站上重新安装anaconda navigator的最新版本：https://www.anaconda.com/distribution/#macos

在安装过程中，它会询问您一些由新的Apple安全策略产生的权限，只需授予它们，它的工作方式就如同在全新安装后一样！