Python:我一直收到广播错误,但不确定如何解决

时间:2019-10-02 18:52:10

标签: python numpy vectorization gradient

我正尝试根据此目的改编此链接中接受的答案代码: Plot gradient arrows over heatmap with plt

我正在一个项目上,该项目需要我以.csv文件的形式拍摄热图像,然后从.csv文件中获取数据以制作箭头(通过quiverplot streamplot等)以显示箭头的方向。从图像上最热点(最高像素值)的热流。我认为可以使用图像的渐变来实现,但是我不确定如何实现。

这是我的代码:

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import math

directory = os.chdir(r'user_directory') #Set folder to look in
file = 'data.csv'
data = np.genfromtxt(file, delimiter = ',')

horizontal_min, horizontal_max, horizontal_stepsize = 0, 100, 0.3
vertical_min, vertical_max, vertical_stepsize = 0, 100, 0.5

horizontal_dist = horizontal_max-horizontal_min
vertical_dist = vertical_max-vertical_min

horizontal_stepsize = horizontal_dist / float(math.ceil(horizontal_dist/float(horizontal_stepsize)))
vertical_stepsize = vertical_dist / float(math.ceil(vertical_dist/float(vertical_stepsize)))

xv, yv = np.meshgrid(np.arange(horizontal_min, horizontal_max, horizontal_stepsize),
                 np.arange(vertical_min, vertical_max, vertical_stepsize))
xv+=horizontal_stepsize/2.0
yv+=vertical_stepsize/2.0

result_matrix = np.asmatrix(data)
yd, xd = np.gradient(result_matrix)

def func_to_vectorize(x, y, dx, dy, scaling=0.01):
    plt.arrow(x, y, dx*scaling, dy*scaling), fc="k", ec="k", head_width=0.06, 
head_length=0.1)

vectorized_arrow_drawing = np.vectorize(func_to_vectorize)

plt.imshow(np.flip(result_matrix,0), extent=[horizontal_min, horizontal_max, vertical_min, 
vertical_max])
vectorized_arrow_drawing(xv, yv, xd, yd, 0.1)
plt.colorbar()
plt.show()

这是我得到的错误:

ValueError: operands could not be broadcast together with shapes (200,335) (200,335) (100,100) (100,100) ()

EDIT: Traceback Error

ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-95-25a8b7e2dff8> in <module>
     46 
     47 plt.imshow(np.flip(result_matrix,0), extent=[horizontal_min, 



horizontal_max, vertical_min, vertical_max])
---> 48 vectorized_arrow_drawing(xv, yv, xd, yd, 0.1)
     49 plt.colorbar()
     50 plt.show()

~\Anaconda3\lib\site-packages\numpy\lib\function_base.py in __call__(self, 
*args, **kwargs)
   1970             vargs.extend([kwargs[_n] for _n in names])
   1971 
-> 1972         return self._vectorize_call(func=func, args=vargs)
   1973 
   1974     def _get_ufunc_and_otypes(self, func, args):

~\Anaconda3\lib\site-packages\numpy\lib\function_base.py in 
_vectorize_call(self, func, args)
   2046                       for a in args]
   2047 
-> 2048             outputs = ufunc(*inputs)
   2049 
   2050             if ufunc.nout == 1:

ValueError: operands could not be broadcast together with shapes (100,168) 
(100,168) (100,100) (100,100) ()

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我猜是由于这对语句而发生错误:

vectorized_arrow_drawing = np.vectorize(func_to_vectorize)
...
vectorized_arrow_drawing(xv, yv, xd, yd, 0.1)

即使我猜对了,也应该发布更多错误消息。

np.vectorize使用broadcasting组合来自输入的值,并为每种组合将一组标量值发送到func_to_vectorize

根据错误,这五个参数具有以下形状:

(200,335) (200,335) (100,100) (100,100) ()

()数组的标量值为0.1。没关系。但是它不能与(100,100)数组一起使用(200,335)数组。 xvyv数组与xdyd数组不兼容。

答案 1 :(得分:0)

您确实需要xd, yd, xv, yv都具有相同的形状(或全部可广播为相同的形状,但是在功能上这是相同的东西)才能使vectorize工作。最简单的方法是:

xv, yv = np.meshgrid(np.linspace(horizontal_min, horizontal_max, data.shape[0]),
                 np.linspace(vertical_min, vertical_max, data.shape[1]))

如果您真的想在一个方向上获得比另一个方向更高的分辨率,则可以使用scipy.interpolate.interp2dxdyd内插到xv和{{ 1}}。但这要复杂得多。