我正尝试根据此目的改编此链接中接受的答案代码: Plot gradient arrows over heatmap with plt
我正在一个项目上,该项目需要我以.csv文件的形式拍摄热图像,然后从.csv文件中获取数据以制作箭头(通过quiverplot streamplot等)以显示箭头的方向。从图像上最热点(最高像素值)的热流。我认为可以使用图像的渐变来实现,但是我不确定如何实现。
这是我的代码:
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import math
directory = os.chdir(r'user_directory') #Set folder to look in
file = 'data.csv'
data = np.genfromtxt(file, delimiter = ',')
horizontal_min, horizontal_max, horizontal_stepsize = 0, 100, 0.3
vertical_min, vertical_max, vertical_stepsize = 0, 100, 0.5
horizontal_dist = horizontal_max-horizontal_min
vertical_dist = vertical_max-vertical_min
horizontal_stepsize = horizontal_dist / float(math.ceil(horizontal_dist/float(horizontal_stepsize)))
vertical_stepsize = vertical_dist / float(math.ceil(vertical_dist/float(vertical_stepsize)))
xv, yv = np.meshgrid(np.arange(horizontal_min, horizontal_max, horizontal_stepsize),
np.arange(vertical_min, vertical_max, vertical_stepsize))
xv+=horizontal_stepsize/2.0
yv+=vertical_stepsize/2.0
result_matrix = np.asmatrix(data)
yd, xd = np.gradient(result_matrix)
def func_to_vectorize(x, y, dx, dy, scaling=0.01):
plt.arrow(x, y, dx*scaling, dy*scaling), fc="k", ec="k", head_width=0.06,
head_length=0.1)
vectorized_arrow_drawing = np.vectorize(func_to_vectorize)
plt.imshow(np.flip(result_matrix,0), extent=[horizontal_min, horizontal_max, vertical_min,
vertical_max])
vectorized_arrow_drawing(xv, yv, xd, yd, 0.1)
plt.colorbar()
plt.show()
这是我得到的错误:
ValueError: operands could not be broadcast together with shapes (200,335) (200,335) (100,100) (100,100) ()
EDIT: Traceback Error
ValueError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-95-25a8b7e2dff8> in <module>
46
47 plt.imshow(np.flip(result_matrix,0), extent=[horizontal_min,
horizontal_max, vertical_min, vertical_max])
---> 48 vectorized_arrow_drawing(xv, yv, xd, yd, 0.1)
49 plt.colorbar()
50 plt.show()
~\Anaconda3\lib\site-packages\numpy\lib\function_base.py in __call__(self,
*args, **kwargs)
1970 vargs.extend([kwargs[_n] for _n in names])
1971
-> 1972 return self._vectorize_call(func=func, args=vargs)
1973
1974 def _get_ufunc_and_otypes(self, func, args):
~\Anaconda3\lib\site-packages\numpy\lib\function_base.py in
_vectorize_call(self, func, args)
2046 for a in args]
2047
-> 2048 outputs = ufunc(*inputs)
2049
2050 if ufunc.nout == 1:
ValueError: operands could not be broadcast together with shapes (100,168)
(100,168) (100,100) (100,100) ()
答案 0 :(得分:0)
我猜是由于这对语句而发生错误:
vectorized_arrow_drawing = np.vectorize(func_to_vectorize)
...
vectorized_arrow_drawing(xv, yv, xd, yd, 0.1)
即使我猜对了,也应该发布更多错误消息。
np.vectorize
使用broadcasting
组合来自输入的值,并为每种组合将一组标量值发送到func_to_vectorize
。
根据错误,这五个参数具有以下形状:
(200,335) (200,335) (100,100) (100,100) ()
()
数组的标量值为0.1。没关系。但是它不能与(100,100)数组一起使用(200,335)数组。 xv
和yv
数组与xd
和yd
数组不兼容。
答案 1 :(得分:0)
您确实需要xd, yd, xv, yv
都具有相同的形状(或全部可广播为相同的形状,但是在功能上这是相同的东西)才能使vectorize
工作。最简单的方法是:
xv, yv = np.meshgrid(np.linspace(horizontal_min, horizontal_max, data.shape[0]),
np.linspace(vertical_min, vertical_max, data.shape[1]))
如果您真的想在一个方向上获得比另一个方向更高的分辨率,则可以使用scipy.interpolate.interp2d
将xd
和yd
内插到xv
和{{ 1}}。但这要复杂得多。