Question

我正在尝试编写一个程序，将一个文件复制到一个字符串（到目前为止很好），它将包含DNA碱基。然后将碱基转化为蛋白质，首先找到第一个ATG序列，然后读取3个序列并转换它们，将它们写入另一个文件。

截至目前，该程序在进入第一个for循环之前崩溃了。我不知道是什么导致了这个问题。

int proteina(char DNA_origem[], char proteina_destino[]){
char aminocidosING [64][14]={"Isoleucine","Isoleucine","Isoleucine","Leucine","Leucine","Leucine","Leucine","Leucine","Leucine","Valine","Valine","Valine","Valine","Phenylalanine","Phenylalanine","Methionine","Cysteine","Cysteine","Alanine","Alanine","Alanine","Alanine","Glycine","Glycine","Glycine","Glycine","Proline","Proline","Proline","Proline","Threonine","Threonine","Threonine","Threonine","Serine","Serine","Serine","Serine","Serine","Serine","Tyrosine","Tyrosine","Tryptophan","Glutamine","Glutamine","Asparagine","Asparagine","Histidine","Histidine","Glutamic acid","Glutamic acid","Aspartic acid","Aspartic acid","Lysine","Lysine","Arginine","Arginine","Arginine","Arginine","Arginine","Arginine","Stop codons","Stop codons","Stop codons"};
char aminocidosPT [64][18]={"Isoleucina","Isoleucina","Isoleucina","Leucina","Leucina","Leucina","Leucina","Leucina","Leucina","Valina","Valina","Valina","Valina","Fenilalanina","Fenilalanina","Metionina","Cisteína","Cisteína","Alanina","Alanina","Alanina","Alanina","Glicina","Glicina","Glicina","Glicina","Prolina","Prolina","Prolina","Prolina","Treonina","Treonina","Treonina","Treonina","Serina","Serina","Serina","Serina","Serina","Serina","Tirosina","Tirosina","Triptofano","Glutamina*","Glutamina","Asparagina","Asparagina","Histidina","Histidina","Ácido glutâmico","Ácido glutâmico","Ácido aspártico","Ácido aspártico","Lisina","Lisina","Arginina","Arginina","Arginina","Arginina","Arginina","Arginina","Códons Stop","Códons Stop","Códons Stop"};
char codoes[64][3]={"ATT","ATC","ATA","CTT","CTC","CTA","CTG","TTA","TTG","GTT","GTC","GTA","GTG","TTT","TTC","ATG","TGT","TGC","GCT","GCC","GCA","GCG","GGT","GGC","GGA","GGG","CCT","CCC","CCA","CCG","ACT","ACC","ACA","ACG","TCT","TCC","TCA","TCG","AGT","AGC","TAT","TAC","TGG","CAA","CAG","AAT","AAC","CAT","CAC","GAA","GAG","GAT","GAC","AAA","AAG","CGT","CGC","CGA","CGG","AGA","AGG","TAA","TAG","TGA"};
char proteinas[64][1] = {"I","I","I","L","L","L","L","L","L","V","V","V","V","F","F","M","C","C","A","A","A","A","G","G","G","G","P","P","P","P","T","T","T","T","S","S","S","S","S","S","Y","Y","W","Q","Q","N","N","H","H","E","E","D","D","K","K","R","R","R","R","R","R",".",".","."};

/* a esta altura suponho que tenhas definido na main as strings dos aminoácidos*/


char **string1; 
FILE * ficheiro;
FILE * ficheiro_close;
int f_cmp; 
int k, i, start=0; /* variavel de comprimento */
char proteina_origem;

ficheiro = fopen(DNA_origem,"r"); /* DNA origem e a variavel onde ta guardada o nome do ficheiro do utilizador */
ficheiro_close = fopen(proteina_destino,"w+");

fscanf(ficheiro,"%c",string1); /* isto lê os conteudos da stream para a string, copiando pra lá o ficheiro. */

for(i=1;i<=f_cmp;i++) {

   if (strncmp(string1[i],codoes[15],3)==0) {
      fputs(proteinas[15],ficheiro_close);

      for(k=i+2;k<=f_cmp;k+3) {

         if ((strncmp(string1[k],codoes[k],3))==0) {
            fputs(proteinas[k],ficheiro_close);

            if (k==61&&k==62&&k==63) {
                return(0);
            }
          }
        }
      }
    }
}

此外，如果我在char定义中不使用**，编译器会发出警告。你能放一些光吗？这应该只是一个简单的项目，但我陷入了最后一个功能..

不要介意var名称和评论，它是葡萄牙语。

非常感谢你的时间！

Answer 1

如果使用指针，则声明后必须使用合适的有效内存初始化指针。初始化之后，指针只指向一个地址，或指向某个其他变量的地址或为此指针创建的内存（例如，使用malloc（）或new运算符）。更好地使用char数组，如果它不会损害您的编码方法来完成手头的任务。

但是，如果将string1声明为

char** string1

像这样使用fscanf：

fscanf(ficheiro,"%c", *string1);

Answer 2

我认为您的fscanf电话有一个问题。您正在尝试扫描值并将其存储在string1变量中，但没有为string1分配内存。正如你现在所知，string1只是一个指向char的指针，因此没有地方存储实际的字符串值。您可以在堆栈上分配它，也可以在堆上分配它。尝试这样的事情：

char string1[80]; // Or use whatever size makes sense here

...

fscanf(ficheiro, "%c", string1);

此外，您可能已经这样做了，但是当您完成它们时，您应该fclose您的文件。

Answer 3

这是错误的：

fscanf(ficheiro,"%c",string1);

我看到string1只声明但未初始化。

打开文件时可能出现问题，可能会将i / o归档为字符串

3 个答案: