如何将.dicom(切片)转换为单个(体积)图像?

时间:2019-09-07 12:40:43

标签: dicom

我有'n'个切片,是否可以将它们转换为单个文件(具有正确的切片排列),并使用ImageIO或任何其他python软件包对其进行解析?

1 个答案:

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我不确定ImageIO是什么,但是要解析一组切片(我假设您的意思是单个CT或MR类型系列,即一个3D体积),请签出simpleITK

我认为它将完全满足您的要求:它是一个非常完整的“ 3d感知” dicom库(并且由于包裹在C库中而非常快)。特别是它将读取完整的多文件系列,并为其创建单个3D表示。

它的表示基于扩展的numpy对象-因此特别是它将为该系列提供3D numpy数组,但此外还知道该系列相对于dicom患者坐标系的3D位置/方向。

因此,一旦有了这些,就可以获得能够与其他任何python库一起使用的所有空间/ 3D信息。