我想用C ++创建一个HDF5文件,并将数据动态添加到该文件中包含的数据集中。但是,以这个最小的示例作为我目前的最佳尝试(主要基于answer的SOG),我在进行这项工作时遇到了一些麻烦:
#include <stdio.h>
#include <HDFql.hpp>
int main (int argc, const char * argv[]) {
char script[1024];
//Create HDF5 file
HDFql::execute("CREATE TRUNCATE FILE /tmp/test.h5");
HDFql::execute("USE FILE /tmp/test.h5");
//Generate some arbitrary data
int data_size = 10;
int data[data_size];
for (int i=0; i<data_size; i++) {data[i]=i+data_size;}
//Create a dataset "dset"
HDFql::execute("CREATE CHUNKED DATASET dset AS INT(UNLIMITED)");
//In the loop, add one element to dset on each iteration
for(int i=0; i<10; i++)
{
HDFql::execute("ALTER DIMENSION dset TO (+1)");
sprintf(script, "INSERT INTO dset(-1:1:1:1) VALUES(%d)", i);
HDFql::execute(script);
}
//Add an array of values to dset
sprintf(script, "ALTER DIMENSION dset TO (%d)", data_size);
HDFql::execute(script);
sprintf(script, "INSERT INTO dset(-1:1:1:1) VALUES(%d)", data_size);
HDFql::execute(script);
//Read all values in dset and print to console
HDFql::execute("SELECT FROM dset");
int cnt=0;
while(HDFql::cursorNext(NULL) == HDFQL_SUCCESS)
{
printf("Value at %d: %d\n", cnt, *HDFql::cursorGetInt(NULL));
cnt++;
}
HDFql::execute("CLOSE FILE");
}
我希望控制台的输出为:
Value at 0: 0
Value at 1: 1
Value at 2: 2
...
Value at 19: 19
相反,输出为:
Value at 0: 10
确实,检查HDF5文件显示它仅包含一个值10。那么我的代码有什么问题,为什么?另外,对hyperslab的简短解释(我在这里很盲目使用)或解释它的文档链接也将非常感谢。
非常感谢!
这是一个基于@SOG答案的工作代码示例:
#include <stdio.h>
#include <HDFql.hpp>
int main (int argc, const char * argv[]) {
char script[1024];
HDFql::execute("CREATE TRUNCATE FILE /tmp/test.h5");
HDFql::execute("USE FILE /tmp/test.h5");
int data_size = 10;
int data[data_size];
for (int i=0; i<data_size; i++) {data[i]=i+data_size;}
HDFql::execute("CREATE CHUNKED DATASET dset AS INT(UNLIMITED)");
for(int i=0; i<10; i++)
{
if(i>0) {HDFql::execute("ALTER DIMENSION dset TO +1");}
sprintf(script, "INSERT INTO dset(-1:1:1:1) VALUES(%d)", i);
HDFql::execute(script);
}
sprintf(script, "ALTER DIMENSION dset TO +%d", data_size);
HDFql::execute(script);
sprintf(script, "INSERT INTO dset(-%d:1:1:%d) VALUES FROM MEMORY %d",
data_size, data_size, HDFql::variableTransientRegister(data));
HDFql::execute(script);
int cnt=0;
HDFql::execute("SELECT FROM dset");
while(HDFql::cursorNext(NULL) == HDFQL_SUCCESS)
{
printf("Value at %d: %d\n", cnt, *HDFql::cursorGetInt(NULL));
cnt++;
}
HDFql::execute("CLOSE FILE");
}
答案 0 :(得分:1)
根据HDFql release notes,操作ALTER DIMENSION
在2.1.0版中更改了语法(即该操作不再需要括号来包围尺寸)。
因此,将您的代码更改为:
HDFql::execute("ALTER DIMENSION dset TO +1");
有关此操作以及超平板的其他信息,可以在HDFql reference manual中找到。