将Jupyter R内核设置为环境版本，而不是系统默认值

Question

今天，我正在Linux机器上的Anaconda中设置R环境。目标是运行R的特定版本，以处理生物信息学管道的依赖性。

到目前为止，我有： 下载并安装Anaconda（v 4.5.4），并为R创建并激活了一个环境：

conda create --name r_3.5.1
conda activate r_3.5.1

在激活的环境中搜索并下载R和R-Essentials的特定版本：

conda search r-base
conda install -c conda-forge r=3.5.1
conda search r-essentials
conda install -c r r-essentials=3.5.1

但是，当我在这种环境中打开jupyter-notebook时，启动一个新的R笔记本并检查version，我正在运行3.2.3版本。这个旧版本似乎是我的/usr/bin/r中的版本，而我想要的R版本是/home/me/anaconda3/envs/r_3.5.1

中的版本

在特定环境中为R打开或创建Jupyter-notebook时，如何指定要打开的R的特定版本？

Answer 1

在环境中打开Jupyter笔记本不足以开始使用指定版本的R。

为解决此问题，我在环境中安装了jupyter：

conda install jupyter

然后，我打开了一个先前存在错误的R内核的jupyter笔记本，并在一个单元格中运行：

install.packages('IRkernel')
IRkernel::installspec()

，并在另一个单元格中用version确认我正在运行正确的版本。