如何在Python中从DICOM文件和/或nifti文件生成曲面网格？

Question

我需要从分段的NIFTI文件生成表面生成。我可以在3D切片器中轻松地做到这一点，但我想在Python中做到这一点。可以在Python中做到吗？

我尝试使用VTK模型，但未显示Surface渲染的输出。

Answer 1

签出simpleITK。它具有可以连续3d感知顺序阅读的工具，还可以为您生成各种表面。

这不是一个可以为您显示内容的应用程序，但是您可以找到许多示例，了解如何获取simpleITK的输出以及如何使用各种可视化选项。

Answer 2

您可以通过在3D Slicer中编写脚本轻松地做到这一点。您无需使用图形用户界面，只需从命令行启动Python脚本即可。您可以将脚本存储库中的示例（例如https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/ScriptRepository#Export_model_nodes_from_segmentation_node）中所需的脚本放在一起。