TL; DR

Question

我已经在使用EnrichR，是否有解决方案？

install.packages("enrichR")

library(enrichR)
dbs <- listEnrichrDbs()

`EnrichR website not responding`

dbs <- c("GO_Molecular_Function_2015", "GO_Cellular_Component_2015", "GO_Biological_Process_2015" , "ChEA_2016" ,"KEGG_2016")
enriched <- enrichr(c("Runx1", "Gfi1", "Gfi1b", "Spi1", "Gata1", "Kdr"), dbs)

`EnrichR website not responding`

或者是否有任何一种快速的方法（不能一一获得）来从Enrichr获取整个表格？

非常感谢！

Answer 1

原始的@MaayanLab #Enrichr API和服务器运行正常。 #Enrichr最近稍作修改，这破坏了R包。该R包是@W_Jawaid独立开发的包装程序，后者最近解决了此问题。请查看以下线程：https://github.com/wjawaid/enrichR/issues/21。 2.0版及更早版本存在一个错误-Github现已提供2.1版正在运行。加载程序包时，它应该测试网站。 CRAN在八月放假，所以还没有2.1。

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现在GitHub上可用的2.1版应该修复它。 install.packages（“ devtools”） devtools :: install_github（“ wjawaid / enrichR”）

如何解决：EnrichR网站没有响应？

1 个答案:

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