我目前被一些EddyData的后期处理所困扰。在一个示例(https://github.com/bgctw/REddyProc/blob/master/vignettes/aggUncertainty.md之后,我想到了group_by
的意外结果,该结果是可重复的,但我不明白为什么。
Group_by仅返回一行,而聚合则给出预期的结果。
这是一个最小的示例:
library(tidyverse)
#create example data frame
date.time <- seq(from=as.POSIXct("2015-01-01 00:30:00"), to=as.POSIXct("2015-01-03 00:30:00"),by="30 mins")
nee <- runif(length(date.time),-200,200)
df <- data.frame(date.time, nee)
#calculate day of the year
df <- df %>% mutate(
date.time = df$date.time
, DoY = as.POSIXlt(date.time - 15*60)$yday # midnight belongs to the previous
)
#trying to summarise nee for each day
aggDay <- df %>% group_by(DoY) %>% summarise(nee=sum(nee))
aggDay
nee
1 322.1195
aggDay仅返回一行,而在这种情况下aggregate
将起作用
aggregate(df$nee, by=list(df$DoY), sum)
Group.1 x
1 0 -25.15698
2 1 448.13960
3 2 -100.86310
不幸的是,原始代码涉及到一些进一步的计算,这就是我想呆在group_by
上的原因。
#original code, not reproducible here
aggDay <- df %>% group_by(DoY) %>%
summarise(
DateTime = first(DateTime)
, nRec = sum( NEE_uStar_fqc == 0, na.rm = TRUE)
, nEff = computeEffectiveNumObs(
resid, effAcf = !!autoCorr, na.rm = TRUE)
, NEE = mean(NEE_uStar_f, na.rm = TRUE)
, sdNEE = if (nEff <= 1) NA_real_ else sqrt(
mean(NEE_uStar_fsd^2, na.rm = TRUE) / (nEff - 1))
, sdNEEuncorr = if (nRec == 0) NA_real_ else sqrt(
mean(NEE_uStar_fsd^2, na.rm = TRUE) / (nRec - 1))
)
答案 0 :(得分:0)
我重新启动了RStudio,现在可以使用了。不要问我另一个加载的软件包一定存在问题。